not needed anymore as Marc always compiles with OpenMP
adopted installation script and documentation accordingly
This commit is contained in:
Franz Roters
parent
9a90eae3bc
commit
b24ebb8a5b
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@ -1,52 +0,0 @@
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#!/bin/ksh
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# 1st arg: $DIR
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# 2nd arg: $DIRJOB
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# 3rd arg: $user
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# 4th arg: $program
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DIR=$1
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user=$3
|
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program=$4
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||||||
usernoext=$user
|
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
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||||||
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||||||
# add BLAS options for linking
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||||||
BLAS="%BLAS%"
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. $DIR/tools/include
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DIRJOB=$2
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cd $DIRJOB
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echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
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||||||
echo "program: $program"
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||||||
$DFORTRAN $user || \
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||||||
{
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||||||
echo "$0: compile failed for $user"
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||||||
exit 1
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}
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||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
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||||||
userobj=$usernoext.o
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||||||
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||||||
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||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
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||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
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||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
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||||||
$MDUSER \
|
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||||||
../lib/mdsrc.a \
|
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||||||
../lib/mcvfit.a \
|
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||||||
$STUBS \
|
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${SOLVERLIBS} \
|
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$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
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||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
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||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
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||||||
exit 1
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||||||
}
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||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
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||||||
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@ -1,52 +0,0 @@
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||||||
#!/bin/ksh
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||||||
# 1st arg: $DIR
|
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||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
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||||||
# 3rd arg: $user
|
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||||||
# 4th arg: $program
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DIR=$1
|
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||||||
user=$3
|
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program=$4
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usernoext=$user
|
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
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||||||
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||||||
# add BLAS options for linking
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||||||
BLAS="%BLAS%"
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||||||
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||||||
. $DIR/tools/include
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||||||
DIRJOB=$2
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||||||
cd $DIRJOB
|
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||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
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||||||
echo "program: $program"
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||||||
$DFORTHIGH $user || \
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||||||
{
|
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||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
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||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTLOW $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_h" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_l" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRAN $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTHIGH $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTLOW $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_h" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_l" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -58,15 +58,9 @@ echo "Editor: $EDITOR"
|
||||||
echo ''
|
echo ''
|
||||||
echo 'adapting Marc tools...'
|
echo 'adapting Marc tools...'
|
||||||
theDIR=$INSTALLDIR/marc$VERSION/tools
|
theDIR=$INSTALLDIR/marc$VERSION/tools
|
||||||
for filename in 'comp_damask' \
|
for filename in 'comp_damask_mp' \
|
||||||
'comp_damask_l' \
|
|
||||||
'comp_damask_h' \
|
|
||||||
'comp_damask_mp' \
|
|
||||||
'comp_damask_lmp' \
|
'comp_damask_lmp' \
|
||||||
'comp_damask_hmp' \
|
'comp_damask_hmp' \
|
||||||
'run_damask' \
|
|
||||||
'run_damask_l' \
|
|
||||||
'run_damask_h' \
|
|
||||||
'run_damask_mp' \
|
'run_damask_mp' \
|
||||||
'run_damask_lmp' \
|
'run_damask_lmp' \
|
||||||
'run_damask_hmp' \
|
'run_damask_hmp' \
|
||||||
|
|
@ -85,15 +79,9 @@ for filename in 'edit_window' \
|
||||||
'submit4' \
|
'submit4' \
|
||||||
'submit5' \
|
'submit5' \
|
||||||
'submit6' \
|
'submit6' \
|
||||||
'submit7' \
|
|
||||||
'submit8' \
|
|
||||||
'submit9' \
|
|
||||||
'kill4' \
|
'kill4' \
|
||||||
'kill5' \
|
'kill5' \
|
||||||
'kill6' \
|
'kill6'; do
|
||||||
'kill7' \
|
|
||||||
'kill8' \
|
|
||||||
'kill9'; do
|
|
||||||
cp $SCRIPTLOCATION/$VERSION/Mentat_bin/$filename $theDIR
|
cp $SCRIPTLOCATION/$VERSION/Mentat_bin/$filename $theDIR
|
||||||
echo $theDIR/$filename | xargs perl -pi -e "s:%INSTALLDIR%:${INSTALLDIR}:g"
|
echo $theDIR/$filename | xargs perl -pi -e "s:%INSTALLDIR%:${INSTALLDIR}:g"
|
||||||
echo $theDIR/$filename | xargs perl -pi -e "s:%VERSION%:${VERSION}:g"
|
echo $theDIR/$filename | xargs perl -pi -e "s:%VERSION%:${VERSION}:g"
|
||||||
|
|
@ -122,8 +110,8 @@ echo ''
|
||||||
echo 'setting file access rights...'
|
echo 'setting file access rights...'
|
||||||
for filename in marc$VERSION/tools/run_damask* \
|
for filename in marc$VERSION/tools/run_damask* \
|
||||||
marc$VERSION/tools/comp_damask* \
|
marc$VERSION/tools/comp_damask* \
|
||||||
mentat$VERSION/bin/submit{4..9} \
|
mentat$VERSION/bin/submit{4..6} \
|
||||||
mentat$VERSION/bin/kill{4..9} ; do
|
mentat$VERSION/bin/kill{4..6} ; do
|
||||||
chmod 755 $INSTALLDIR/${filename}
|
chmod 755 $INSTALLDIR/${filename}
|
||||||
done
|
done
|
||||||
|
|
||||||
|
|
@ -142,10 +130,7 @@ if [ -d "$BIN_DIR" ]; then
|
||||||
echo 'creating symlinks ...'
|
echo 'creating symlinks ...'
|
||||||
echo''
|
echo''
|
||||||
theDIR=$INSTALLDIR/marc$VERSION/tools
|
theDIR=$INSTALLDIR/marc$VERSION/tools
|
||||||
for filename in 'run_damask' \
|
for filename in 'run_damask_mp' \
|
||||||
'run_damask_l' \
|
|
||||||
'run_damask_h' \
|
|
||||||
'run_damask_mp' \
|
|
||||||
'run_damask_lmp' \
|
'run_damask_lmp' \
|
||||||
'run_damask_hmp'; do
|
'run_damask_hmp'; do
|
||||||
echo ${filename:4}$VERSION
|
echo ${filename:4}$VERSION
|
||||||
|
|
|
||||||
|
|
@ -21,16 +21,10 @@ The structure of this directory should be (VERSION = 20XX or 20XX.Y)
|
||||||
./installation.txt this text
|
./installation.txt this text
|
||||||
./apply_MPIE_modifications script file to apply modifications to the installation
|
./apply_MPIE_modifications script file to apply modifications to the installation
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_user.original original file from installation
|
./VERSION/Marc_tools/comp_user.original original file from installation
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_damask modified version using -O1 optimization
|
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_l modified version using -O0 optimization
|
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_h modified version using -O2 optimization
|
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_mp modified version using -O1 optimization and OpenMP
|
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_mp modified version using -O1 optimization and OpenMP
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_lmp modified version using -O0 optimization and OpenMP
|
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_lmp modified version using -O0 optimization and OpenMP
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_hmp modified version using -O2 optimization and OpenMP
|
./VERSION/Marc_tools/comp_damask_hmp modified version using -O2 optimization and OpenMP
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_marc.original original file from installation
|
./VERSION/Marc_tools/run_marc.original original file from installation
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_damask modified version using -O1 optimization
|
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_damask_l modified version using -O0 optimization
|
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_damask_h modified version using -O2 optimization
|
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_damask_mp modified version using -O1 optimization and OpenMP
|
./VERSION/Marc_tools/run_damask_mp modified version using -O1 optimization and OpenMP
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_damask_lmp modified version using -O0 optimization and OpenMP
|
./VERSION/Marc_tools/run_damask_lmp modified version using -O0 optimization and OpenMP
|
||||||
./VERSION/Marc_tools/run_damask_hmp modified version using -O2 optimization and OpenMP
|
./VERSION/Marc_tools/run_damask_hmp modified version using -O2 optimization and OpenMP
|
||||||
|
|
@ -42,14 +36,8 @@ The structure of this directory should be (VERSION = 20XX or 20XX.Y)
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/submit4 modified version of original calling run_h_marc
|
./VERSION/Mentat_bin/submit4 modified version of original calling run_h_marc
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/submit5 modified version of original calling run_marc
|
./VERSION/Mentat_bin/submit5 modified version of original calling run_marc
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/submit6 modified version of original calling run_l_marc
|
./VERSION/Mentat_bin/submit6 modified version of original calling run_l_marc
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/submit7 modified version of original calling run_hmp_marc
|
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/submit8 modified version of original calling run_mp_marc
|
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/submit9 modified version of original calling run_lmp_marc
|
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/kill4 kill file for submit4, identical to original kill1
|
./VERSION/Mentat_bin/kill4 kill file for submit4, identical to original kill1
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/kill5 kill file for submit5, identical to original kill1
|
./VERSION/Mentat_bin/kill5 kill file for submit5, identical to original kill1
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/kill6 kill file for submit6, identical to original kill1
|
./VERSION/Mentat_bin/kill6 kill file for submit6, identical to original kill1
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/kill7 kill file for submit7, identical to original kill1
|
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/kill8 kill file for submit8, identical to original kill1
|
|
||||||
./VERSION/Mentat_bin/kill9 kill file for submit9, identical to original kill1
|
|
||||||
./VERSION/Mentat_menus/job_run.ms.original original file from installation
|
./VERSION/Mentat_menus/job_run.ms.original original file from installation
|
||||||
./VERSION/Mentat_menus/job_run.ms modified version adding DAMASK menu to run menu
|
./VERSION/Mentat_menus/job_run.ms modified version adding DAMASK menu to run menu
|
||||||
|
|
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