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Martin Diehl
parent
ba80c8336e
commit
4817417aa1
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@ -1,52 +0,0 @@
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#!/bin/ksh
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# 1st arg: $DIR
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# 2nd arg: $DIRJOB
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# 3rd arg: $user
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# 4th arg: $program
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DIR=$1
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user=$3
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program=$4
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usernoext=$user
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
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# add BLAS options for linking
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BLAS="%BLAS%"
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. $DIR/tools/include
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DIRJOB=$2
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cd $DIRJOB
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echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
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echo "program: $program"
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$DFORTRAN $user || \
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{
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echo "$0: compile failed for $user"
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exit 1
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}
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/bin/rm $program 2>/dev/null
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userobj=$usernoext.o
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$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
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$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
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${userobj-} \
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$DIR/lib/srclib.a \
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$MNFLIBS \
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$MDUSER \
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../lib/mdsrc.a \
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../lib/mcvfit.a \
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$STUBS \
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${SOLVERLIBS} \
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$TKLIBS \
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$MRCLIBS \
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$METISLIBS \
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$BLAS \
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$SYSLIBS || \
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{
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echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
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exit 1
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}
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/bin/rm $userobj
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/bin/rm $DIRJOB/*.mod
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@ -1,52 +0,0 @@
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#!/bin/ksh
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# 1st arg: $DIR
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# 2nd arg: $DIRJOB
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# 3rd arg: $user
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# 4th arg: $program
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DIR=$1
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user=$3
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program=$4
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usernoext=$user
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
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# add BLAS options for linking
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BLAS="%BLAS%"
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. $DIR/tools/include
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DIRJOB=$2
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cd $DIRJOB
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echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
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echo "program: $program"
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$DFORTHIGH $user || \
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{
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echo "$0: compile failed for $user"
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exit 1
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}
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/bin/rm $program 2>/dev/null
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userobj=$usernoext.o
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$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
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$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
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${userobj-} \
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$DIR/lib/srclib.a \
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$MNFLIBS \
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$MDUSER \
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../lib/mdsrc.a \
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../lib/mcvfit.a \
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$STUBS \
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${SOLVERLIBS} \
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$TKLIBS \
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$MRCLIBS \
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$METISLIBS \
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$BLAS \
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$SYSLIBS || \
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{
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echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
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exit 1
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}
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/bin/rm $userobj
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/bin/rm $DIRJOB/*.mod
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@ -1,52 +0,0 @@
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#!/bin/ksh
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||||||
# 1st arg: $DIR
|
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||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
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# 3rd arg: $user
|
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# 4th arg: $program
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DIR=$1
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user=$3
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program=$4
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usernoext=$user
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
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# add BLAS options for linking
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BLAS="%BLAS%"
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. $DIR/tools/include
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DIRJOB=$2
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cd $DIRJOB
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echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
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echo "program: $program"
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$DFORTHIGHMP $user || \
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{
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echo "$0: compile failed for $user"
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exit 1
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}
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/bin/rm $program 2>/dev/null
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userobj=$usernoext.o
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$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
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$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
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${userobj-} \
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$DIR/lib/srclib.a \
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$MNFLIBS \
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$MDUSER \
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../lib/mdsrc.a \
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../lib/mcvfit.a \
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$STUBS \
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${SOLVERLIBS} \
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$TKLIBS \
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$MRCLIBS \
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$METISLIBS \
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$BLAS \
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$SYSLIBS || \
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{
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echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
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exit 1
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}
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/bin/rm $userobj
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/bin/rm $DIRJOB/*.mod
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@ -1,52 +0,0 @@
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#!/bin/ksh
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||||||
# 1st arg: $DIR
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# 2nd arg: $DIRJOB
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# 3rd arg: $user
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# 4th arg: $program
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DIR=$1
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user=$3
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program=$4
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usernoext=$user
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usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
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||||||
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# add BLAS options for linking
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BLAS="%BLAS%"
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. $DIR/tools/include
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DIRJOB=$2
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cd $DIRJOB
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||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
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||||||
echo "program: $program"
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||||||
$DFORTLOW $user || \
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{
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||||||
echo "$0: compile failed for $user"
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||||||
exit 1
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||||||
}
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/bin/rm $program 2>/dev/null
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||||||
userobj=$usernoext.o
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||||||
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||||||
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||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
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||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
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||||||
${userobj-} \
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||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
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||||||
$MNFLIBS \
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||||||
$MDUSER \
|
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||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
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||||||
{
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||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
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||||||
exit 1
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||||||
}
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||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
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||||||
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@ -1,52 +0,0 @@
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||||||
#!/bin/ksh
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# 1st arg: $DIR
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# 2nd arg: $DIRJOB
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||||||
# 3rd arg: $user
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# 4th arg: $program
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DIR=$1
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||||||
user=$3
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||||||
program=$4
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||||||
usernoext=$user
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||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
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||||||
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||||||
# add BLAS options for linking
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||||||
BLAS="%BLAS%"
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||||||
. $DIR/tools/include
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||||||
DIRJOB=$2
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||||||
cd $DIRJOB
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echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
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echo "program: $program"
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||||||
$DFORTRANLOWMP $user || \
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||||||
{
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||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
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||||||
exit 1
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||||||
}
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||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
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||||||
userobj=$usernoext.o
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||||||
|
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||||||
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||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
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||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
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||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRANMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,41 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user.f on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$FORTRAN $user.f || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user.f"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$user.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $user.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
|
|
@ -1,748 +0,0 @@
|
||||||
#
|
|
||||||
# General definitions for the Marc 2014 version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# EM64T
|
|
||||||
# ( LP64 - i4 version)
|
|
||||||
# (ILP64 - i8 version)
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Linux RedHat 5.7
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# 64 bit MPI version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) Fortran Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) C Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MKL Libraries:
|
|
||||||
# Intel(R) MKL 10.3
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# DATE
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the O/S level, type:
|
|
||||||
# uname -a
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Distributed parallel MPI libraries:
|
|
||||||
# 1) HP MPI 2.3
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
# 2) Intel MPI 4.0
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the Compiler level, type using the compiler
|
|
||||||
# installation path:
|
|
||||||
# ifort -V
|
|
||||||
# icc -V
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# REMARKS : This file contains the definitions of variables used during
|
|
||||||
# compilation loading and use of the MARC programmes . The
|
|
||||||
# current machine type is identified by means of the variable
|
|
||||||
# MACHINE , defined below.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MPI_ROOT: root directory in which mpi shared libraries, etc. are located
|
|
||||||
# DIRJOB : directory in which spawned jobs should look for Marc input
|
|
||||||
# MPI_ARCH: system architecture
|
|
||||||
# MPI_EPATH: path where executable resides
|
|
||||||
#
|
|
||||||
REVISION="VERSION, BUILD"
|
|
||||||
HOSTNAME=`hostname`
|
|
||||||
|
|
||||||
# find available memory in Mbyte on the machine
|
|
||||||
# can be set explicitly
|
|
||||||
MEMLIMIT=`free -m | awk '/Mem:/ {print $2}'`
|
|
||||||
|
|
||||||
# set _OEM_NASTRAN to 1 for MD Nastran build
|
|
||||||
# override _OEM_NASTRAN setting with MARC_MD_NASTRAN environment variable
|
|
||||||
_OEM_NASTRAN="${MARC_MD_NASTRAN:-0}"
|
|
||||||
|
|
||||||
# uncomment the following line for an autoforge build
|
|
||||||
#AUTOFORGE=1
|
|
||||||
AUTOFORGE=0
|
|
||||||
export AUTOFORGE
|
|
||||||
|
|
||||||
# integer size
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "" ; then
|
|
||||||
INTEGER_PATH=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTEGER_PATH=/$MARC_INTEGER_SIZE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FCOMP=ifort
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for Metis
|
|
||||||
#
|
|
||||||
METIS="-I$METIS_SOURCE/include"
|
|
||||||
METISLIBS="$MARC_LIB/metis.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# RCP and RSH are used for parallel network runs
|
|
||||||
# replace with similar commands like rsh if needed
|
|
||||||
RCP=/usr/bin/scp
|
|
||||||
RSH=/usr/bin/ssh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MPI_DEFAULT=intelmpi
|
|
||||||
MPI_OTHER=hpmpi
|
|
||||||
|
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||||||
MPITYPE=$MPI_DEFAULT
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE = 1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# overrule MPITYPE setting with environmental variable MARC_MPITYPE
|
|
||||||
if test $MARC_MPITYPE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=$MARC_MPITYPE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set MPITYPE to none for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with GPGPU version of BCS Solver for
|
|
||||||
# NVIDIA platforms
|
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||||||
#BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=BCSGPU
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERFLAGS=
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DBCSGPU -DCUDA"
|
|
||||||
BCS_DIR=bcsgpusolver
|
|
||||||
export PATH=$MARC_CUDA/bin:$MARC_CUDA/nvvm:$PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MARC_CUDA/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCS_DIR=bcssolver
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
DDM=
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpif90
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_HPMPI
|
|
||||||
export MPI_REMSH=$RSH
|
|
||||||
export MPI_F77=$FCOMP
|
|
||||||
ARCHITECTURE=linux_amd64
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include/64 -DDDM -DHPMPI"
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
export MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE:$MARC_LIB:$MARC_LIB_SHARED:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="-e MPI_FLAGS=E,T,y1"
|
|
||||||
# Below line is moved in run_marc file
|
|
||||||
# export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e BINDIR=$MARC_BIN"
|
|
||||||
if test -n "$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MSC_LICENSE_FILE=$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test -n "$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LM_LICENSE_FILE=$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MPI_LIC_CHECKER=$MPI_ROOT/bin/licensing/amd64_s8/lichk.x"
|
|
||||||
RUN_JOB2="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -f "
|
|
||||||
RUN_JOB1="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -w $MPIHPSPECIAL -np "
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
INTELMPI_VERSION=HYDRA
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpiifort
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_INTELMPI
|
|
||||||
DDM="-I${MPI_ROOT}/include64 -DDDM"
|
|
||||||
PATH=$MPI_ROOT/bin64:$PATH
|
|
||||||
export PATH
|
|
||||||
LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
if test $INTELMPI_VERSION = HYDRA
|
|
||||||
then
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -configfile "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
MPIR_HOME=$MPI_ROOT
|
|
||||||
MPICH_F77=$FCOMP
|
|
||||||
MPICH_F77LINKER=$FCOMP
|
|
||||||
export MPI_ROOT MPI_EPATH MPIR_HOME MPICH_F77 MPICH_F77LINKER
|
|
||||||
I_MPI_PIN_DOMAIN=node
|
|
||||||
export I_MPI_PIN_DOMAIN
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# variables for the "maintain" script
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
MACHINENAME=LINUX
|
|
||||||
MACHINE64BIT=yes
|
|
||||||
MACHINE=Linux_EM64T
|
|
||||||
DEV=/dev/tape
|
|
||||||
GETLOG="whoami"
|
|
||||||
CLEAR="clear"
|
|
||||||
MY_UNAME=`uname -a`
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with VKI Solver
|
|
||||||
#VKISOLVER=VKI
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with CASI Solver
|
|
||||||
CASISOLVER=CASI
|
|
||||||
#CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with MF2 Solver
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
#MF2SOLVER=SERIAL
|
|
||||||
#MF2SOLVER=MF2PARALLEL
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with Intel(c) Multithreaded solver (PARDISO)
|
|
||||||
#INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=PARDISO
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with MUMPS
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
else
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build MARC dynamic shared library
|
|
||||||
MARC_DLL=MARC_DLL
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set VKISOLVER, CASISOLVER, BCSGPUSOLVER, and MARC_DLL to NONE for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define Fortran and C compile syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DVKI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DCASI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2PARALLEL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2SERIAL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2SERIAL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DPARDISO"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMUMPS"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMARC_DLL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LINK_OPT=
|
|
||||||
DEBUG_OPT=
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT=
|
|
||||||
|
|
||||||
#Uncomment following line to build Marc in debuggable mode
|
|
||||||
MARCDEBUG=
|
|
||||||
#MARCDEBUG="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LINK_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCHECK=
|
|
||||||
#MARCCHECK="ON"
|
|
||||||
if test "$MARCCHECK" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DEBUG_OPT="$DEBUG_OPT -fpe0 -fp-stack-check -check all -ftrapuv "
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="$C_DEBUG_OPT -fp-stack-check -check-uninit -Wformat -ftrapuv "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODECOV=
|
|
||||||
#MARCCODECOV="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODEPROF=
|
|
||||||
#MARCCODEPROF="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
I8FFLAGS="-real-size 64 -integer-size 32"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DFLOAT=8 -DINT=4"
|
|
||||||
I8CDEFINES=
|
|
||||||
I8CASIDEFS=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
I8FFLAGS="-i8 -real-size 64 -integer-size 64"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DI64 -DFLOAT=8 -DINT=8"
|
|
||||||
I8CDEFINES="-U_DOUBLE -D_SINGLE"
|
|
||||||
I8CASIDEFS="-DCASI_64BIT_INT=1"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MTHREAD=OPENMP
|
|
||||||
if test "$MARC_OPENMP" = "NONE" ; then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#MTHREAD=NONE
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
OMP_COMPAT=YES
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "NONE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CDEFINES=
|
|
||||||
FDEFINES=
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_IMPLICITNONE"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -eq 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DMKL -DOPENMP"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DOMP_COMPAT"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# -D_MSCMARC
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_MSCMARC $DEBUG_OPT"
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_MSCMARC $C_DEBUG_OPT $I8CDEFINES"
|
|
||||||
|
|
||||||
CINCL="-I$MARC_SOURCE/mdsrc -I$MARC_SOURCE/csource $METIS"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CINCL="$CINCL -I../../include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CC="icc -c -O1 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -O0 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -O3 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CC="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOAD_CC="icc -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel"
|
|
||||||
CCT="$CC"
|
|
||||||
CCTLOW="$CCLOW"
|
|
||||||
CCTHIGH="$CCHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
CC_CASI="$CC -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
CCT_CASI="$CCT -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=lines"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func,mpi"
|
|
||||||
PROFILE=
|
|
||||||
if test "$MARCCODECOV" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE="-prof-gen=srcpos"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MARCCODEPROF" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE=" $PROFILE -pg"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORT_OPT="-c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr -mp1 -WB"
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "OPENMP"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp"
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp-threadprivate=compat"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
# FORT_OPT=" $FORT_OPT -auto "
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -save -zero"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
# determine DAMASK version
|
|
||||||
HIT=0
|
|
||||||
for arg in "$@"
|
|
||||||
do
|
|
||||||
if [ $HIT = 1 ]
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DAMASKPATH=`dirname $arg`
|
|
||||||
break
|
|
||||||
elif [ ${arg:0:2} = -u -o ${arg:0:2} = -U ]
|
|
||||||
then
|
|
||||||
HIT=1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
done
|
|
||||||
read DAMASKVERSION < $DAMASKPATH/../VERSION
|
|
||||||
DAMASKVERSION="'"$DAMASKVERSION"'"
|
|
||||||
|
|
||||||
# DAMASK compiler calls: additional flags are in line 2 OpenMP flags in line 3
|
|
||||||
DFORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTLOWMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRANMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O2 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGHMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -fno-alias -O2 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
# DAMASK compiler calls: additional flags are in line 2 OpenMP flags in line 3
|
|
||||||
DFORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTLOWMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRANMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGHMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_std_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014.2 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOWT="$FORTLOW"
|
|
||||||
FORTRANT="$FORTRAN"
|
|
||||||
FORTHIGHT="$FORTHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FCOMP -c $FDEFINES "
|
|
||||||
CCMNF="icc -c -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel -Dport2egcs -I$MARC_SOURCE/marctoadams/mnf/include -D_LARGEFILE64_SOURCE"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMUMPS="$FCOMP -fpp $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O1 -fp-model precise $FDEFINES -D_IMPLICITNONE $I8FFLAGS $I8DEFINES $DDM -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include -Dintel_ -DALLOW_NON_INIT -Dmetis -nofor_main"
|
|
||||||
CCMUMPS="icc -c -DAdd_ -Dmetis -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BCSCC="icc -c -O3 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_csrc $CDEFINES $CINCL"
|
|
||||||
NVCC="nvcc -c -O3 -arch sm_20 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_cuda/include -I${MARC_CUDA}/include -I$MARC_SOURCE/mdsrc $I8DEFINES -Xcompiler -fvisibility=hidden -Xcompiler -fPIC $I8DEFINES "
|
|
||||||
NVCCLIB="ar rvl"
|
|
||||||
NVCCLD=icc
|
|
||||||
BCSFORTLOW="$FORTLOW -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTRAN="$FORTRAN -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTHIGH="$FORTHIGH -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH="$BCSFORTHIGH"
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSFORTRAN=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORTHIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the tracer and commnet out the next 5 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# INCLUDEMPI="-I$MPI_ROOT/include64 -I$VT_ROOT/include"
|
|
||||||
# LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
LOAD="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FORTLOW -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRAN="$FORTRAN -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FORTHIGH -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FORTRANMNF -fpp -fPIC"
|
|
||||||
CC="$CC -fPIC"
|
|
||||||
CCMNF="$CCMNF -fPIC"
|
|
||||||
CC_CASI="$CC_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH_CASI -fPIC"
|
|
||||||
LINK_EXE_MARC="-L$MARC_LIB -lmarc -L$MARC_LIB_SHARED -lguide -lpthread"
|
|
||||||
LINK_MARC_DLL="-shared -fPIC"
|
|
||||||
LOAD_DLL=$LOAD
|
|
||||||
LOADT_DLL=$LOADT
|
|
||||||
EXT_DLL="so"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
XLIBS="-L/usr/X11/lib -lX11 "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define archive and ranlib syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
ARC="ar rvl"
|
|
||||||
ARD="ar dvl"
|
|
||||||
ARX="ar xl"
|
|
||||||
RAN=""
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# choose which libraries you want to use ( e.g. blas )
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS="$MARC_LIB/vkisolver.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS="$MARC_CASI/casilib.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS=
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS="$MARC_LIB/mf2parallel/libseq.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libsym.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmet.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libnum.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libutl.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libr8.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libz.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS="$MARC_LIB/libmumps.a"
|
|
||||||
if test $MPITYPE = none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
echo hello > /dev/null
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS=
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcsgpulib.a "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS1="-L${MARC_LIB}/cuda_dummy -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS2="-L${MARC_LIB}/cuda -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS=$MARCCUDALIBS1
|
|
||||||
CUDALIBS="-L$MARC_CUDA/lib64 -lcudart -lcublas -L/usr/lib64 -lcuda "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcslib.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_lp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_core.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_ilp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_core.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SECLIBS="-L$MARC_LIB -llapi"
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS="${BCSSOLVERLIBS} ${VKISOLVERLIBS} ${CASISOLVERLIBS} ${INTELSOLVERLIBS} ${MF2SOLVERLIBS} ${MUMPSSOLVERLIBS2} \
|
|
||||||
$MKLLIB -L$MARC_MKL -liomp5 \
|
|
||||||
$MARC_LIB/blas_src.a ${ACSI_LIB}/ACSI_MarcLib.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS_DLL=${SOLVERLIBS}
|
|
||||||
|
|
||||||
MRCLIBS="$MARC_LIB/clib.a ${CASISOLVERLIBS}"
|
|
||||||
MRCLIBSPAR="$MARC_LIB/clib.a"
|
|
||||||
STUBS="$MARC_LIB/stubs.a "
|
|
||||||
MNFLIBS="$MARC_LIB/libmnf.a"
|
|
||||||
MDUSER="$MARC_LIB/md_user.a"
|
|
||||||
|
|
||||||
OPENMP="-openmp"
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBS=" $OPENMP -lpthread "
|
|
||||||
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the trace and comment out the next 4 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# SYSLIBS="-L${VT_ROOT}/lib -lVT -ldwarf -lelf -lm -lpthread \
|
|
||||||
# -L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt"
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SYSLIBS="-L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt $OPENMP -threads -lpthread"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBSPAR=" "
|
|
||||||
|
|
||||||
MARC_DLL_CODES="runmarc.f"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BLAS_SRC="dzero.f icopy.f izero.f"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
BLAS_SRC="$BLAS_SRC dsctr.f zsctr.f dzasum.f daxpyi.f zaxpyi.f dgthr.f zgthr.f"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BLAS_SRC="ALL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="are163.f contro.f ndext.f omarc.f omarca.f omarcb.f omarcc.f \
|
|
||||||
omars.f fixbc.f triang.f bet049.f norst3.f eldata.f \
|
|
||||||
elec*.f elct*.f fmeig.f oada00.f ogeig.f updtrbe2.f cycrota.f \
|
|
||||||
cordef.f ogpk.f ogtan.f eldam.f formrbe3.f \
|
|
||||||
inertie.f em_sso072.f cn_fol3d_qpatch6.f cosim_begin.f"
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i8" ; then
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="$LOW_OPT_CODES bbcseg.f"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES_CASI=""
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES="dpsmsa1.f dpsmsa2.f dpsmsa3.f dpsmsa4.f dpsmsa5.f dpsmsa6.f \
|
|
||||||
dpsmsa7.f dpsmsa8.f dpsmsa9.f dpsmsa10.f dpsmsa11.f dpsmsa12.f \
|
|
||||||
dpsmsa13.f dpsmsa14.f dpsmsa15.f dpsmsa16.f dpsmsah.f tpsmsah.f cn_qsort4_11.f "
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES_CASI="arithkernels.c blockedroutines.c blockedroutines_fd.c elemmatgenkernels.c longvecroutines.c sfmultutils.c solvewithbd.c"
|
|
||||||
|
|
||||||
MAXNUM=1000000
|
|
||||||
|
|
@ -1,685 +0,0 @@
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||||||
#
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||||||
# General definitions for the Marc 2014 version
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||||||
#
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||||||
# EM64T
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||||||
# ( LP64 - i4 version)
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||||||
# (ILP64 - i8 version)
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||||||
#
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||||||
# Linux RedHat 5.7
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||||||
#
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|
||||||
# 64 bit MPI version
|
|
||||||
#
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|
||||||
# Intel(R) Fortran Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) C Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MKL Libraries:
|
|
||||||
# Intel(R) MKL 10.3
|
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||||||
#
|
|
||||||
# DATE
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||||||
#
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||||||
# To check the O/S level, type:
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||||||
# uname -a
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||||||
#
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||||||
# Distributed parallel MPI libraries:
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||||||
# 1) HP MPI 2.3
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|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
# 2) Intel MPI 4.0
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the Compiler level, type using the compiler
|
|
||||||
# installation path:
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||||||
# ifort -V
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||||||
# icc -V
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|
||||||
#
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||||||
# REMARKS : This file contains the definitions of variables used during
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|
||||||
# compilation loading and use of the MARC programmes . The
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||||||
# current machine type is identified by means of the variable
|
|
||||||
# MACHINE , defined below.
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|
||||||
#
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|
||||||
#
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||||||
# MPI_ROOT: root directory in which mpi shared libraries, etc. are located
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||||||
# DIRJOB : directory in which spawned jobs should look for Marc input
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||||||
# MPI_ARCH: system architecture
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||||||
# MPI_EPATH: path where executable resides
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||||||
#
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||||||
REVISION="VERSION, BUILD"
|
|
||||||
HOSTNAME=`hostname`
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|
||||||
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|
||||||
# find available memory in Mbyte on the machine
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|
||||||
# can be set explicitly
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|
||||||
MEMLIMIT=`free -m | awk '/Mem:/ {print $2}'`
|
|
||||||
|
|
||||||
# set _OEM_NASTRAN to 1 for MD Nastran build
|
|
||||||
# override _OEM_NASTRAN setting with MARC_MD_NASTRAN environment variable
|
|
||||||
_OEM_NASTRAN="${MARC_MD_NASTRAN:-0}"
|
|
||||||
|
|
||||||
# uncomment the following line for an autoforge build
|
|
||||||
#AUTOFORGE=1
|
|
||||||
AUTOFORGE=0
|
|
||||||
export AUTOFORGE
|
|
||||||
|
|
||||||
# integer size
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||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "" ; then
|
|
||||||
INTEGER_PATH=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTEGER_PATH=/$MARC_INTEGER_SIZE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FCOMP=ifort
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for Metis
|
|
||||||
#
|
|
||||||
METIS="-I$METIS_SOURCE/include"
|
|
||||||
METISLIBS="$MARC_LIB/metis.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# RCP and RSH are used for parallel network runs
|
|
||||||
# replace with similar commands like rsh if needed
|
|
||||||
RCP=/usr/bin/scp
|
|
||||||
RSH=/usr/bin/ssh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MPI_DEFAULT=intelmpi
|
|
||||||
MPI_OTHER=hpmpi
|
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||||||
|
|
||||||
MPITYPE=$MPI_DEFAULT
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE = 1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# overrule MPITYPE setting with environmental variable MARC_MPITYPE
|
|
||||||
if test $MARC_MPITYPE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=$MARC_MPITYPE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set MPITYPE to none for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with GPGPU version of BCS Solver for
|
|
||||||
# NVIDIA platforms
|
|
||||||
#BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=BCSGPU
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERFLAGS=
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DBCSGPU -DCUDA"
|
|
||||||
BCS_DIR=bcsgpusolver
|
|
||||||
export PATH=$MARC_CUDA/bin:$MARC_CUDA/nvvm:$PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MARC_CUDA/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCS_DIR=bcssolver
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
DDM=
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpif90
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_HPMPI
|
|
||||||
export MPI_REMSH=$RSH
|
|
||||||
export MPI_F77=$FCOMP
|
|
||||||
ARCHITECTURE=linux_amd64
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include/64 -DDDM -DHPMPI"
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
export MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE:$MARC_LIB:$MARC_LIB_SHARED:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="-e MPI_FLAGS=E,T,y1"
|
|
||||||
# Below line is moved in run_marc file
|
|
||||||
# export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e BINDIR=$MARC_BIN"
|
|
||||||
if test -n "$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MSC_LICENSE_FILE=$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test -n "$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LM_LICENSE_FILE=$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MPI_LIC_CHECKER=$MPI_ROOT/bin/licensing/amd64_s8/lichk.x"
|
|
||||||
RUN_JOB2="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -f "
|
|
||||||
RUN_JOB1="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -w $MPIHPSPECIAL -np "
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
INTELMPI_VERSION=HYDRA
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpiifort
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_INTELMPI
|
|
||||||
DDM="-I${MPI_ROOT}/include64 -DDDM"
|
|
||||||
PATH=$MPI_ROOT/bin64:$PATH
|
|
||||||
export PATH
|
|
||||||
LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
if test $INTELMPI_VERSION = HYDRA
|
|
||||||
then
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -configfile "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
MPIR_HOME=$MPI_ROOT
|
|
||||||
MPICH_F77=$FCOMP
|
|
||||||
MPICH_F77LINKER=$FCOMP
|
|
||||||
export MPI_ROOT MPI_EPATH MPIR_HOME MPICH_F77 MPICH_F77LINKER
|
|
||||||
I_MPI_PIN_DOMAIN=node
|
|
||||||
export I_MPI_PIN_DOMAIN
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# variables for the "maintain" script
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
MACHINENAME=LINUX
|
|
||||||
MACHINE64BIT=yes
|
|
||||||
MACHINE=Linux_EM64T
|
|
||||||
DEV=/dev/tape
|
|
||||||
GETLOG="whoami"
|
|
||||||
CLEAR="clear"
|
|
||||||
MY_UNAME=`uname -a`
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with VKI Solver
|
|
||||||
#VKISOLVER=VKI
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with CASI Solver
|
|
||||||
CASISOLVER=CASI
|
|
||||||
#CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with MF2 Solver
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
#MF2SOLVER=SERIAL
|
|
||||||
#MF2SOLVER=MF2PARALLEL
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with Intel(c) Multithreaded solver (PARDISO)
|
|
||||||
#INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=PARDISO
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with MUMPS
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
else
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build MARC dynamic shared library
|
|
||||||
MARC_DLL=MARC_DLL
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set VKISOLVER, CASISOLVER, BCSGPUSOLVER, and MARC_DLL to NONE for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define Fortran and C compile syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DVKI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DCASI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2PARALLEL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2SERIAL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2SERIAL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DPARDISO"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMUMPS"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMARC_DLL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LINK_OPT=
|
|
||||||
DEBUG_OPT=
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT=
|
|
||||||
|
|
||||||
#Uncomment following line to build Marc in debuggable mode
|
|
||||||
MARCDEBUG=
|
|
||||||
#MARCDEBUG="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LINK_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCHECK=
|
|
||||||
#MARCCHECK="ON"
|
|
||||||
if test "$MARCCHECK" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DEBUG_OPT="$DEBUG_OPT -fpe0 -fp-stack-check -check all -ftrapuv "
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="$C_DEBUG_OPT -fp-stack-check -check-uninit -Wformat -ftrapuv "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODECOV=
|
|
||||||
#MARCCODECOV="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODEPROF=
|
|
||||||
#MARCCODEPROF="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
I8FFLAGS=
|
|
||||||
I8DEFINES=
|
|
||||||
I8CDEFINES=
|
|
||||||
I8CASIDEFS=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
I8FFLAGS="-i8"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DI64"
|
|
||||||
I8CDEFINES="-U_DOUBLE -D_SINGLE"
|
|
||||||
I8CASIDEFS="-DCASI_64BIT_INT=1"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MTHREAD=OPENMP
|
|
||||||
if test "$MARC_OPENMP" = "NONE" ; then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#MTHREAD=NONE
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
OMP_COMPAT=YES
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "NONE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CDEFINES=
|
|
||||||
FDEFINES=
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_IMPLICITNONE"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -eq 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DMKL -DOPENMP"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DOMP_COMPAT"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# -D_MSCMARC
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_MSCMARC $DEBUG_OPT"
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_MSCMARC $C_DEBUG_OPT $I8CDEFINES"
|
|
||||||
|
|
||||||
CINCL="-I$MARC_SOURCE/mdsrc -I$MARC_SOURCE/csource $METIS"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CINCL="$CINCL -I../../include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CC="icc -c -O1 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -O0 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -O3 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CC="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOAD_CC="icc -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel"
|
|
||||||
CCT="$CC"
|
|
||||||
CCTLOW="$CCLOW"
|
|
||||||
CCTHIGH="$CCHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
CC_CASI="$CC -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
CCT_CASI="$CCT -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=lines"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func,mpi"
|
|
||||||
PROFILE=
|
|
||||||
if test "$MARCCODECOV" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE="-prof-gen=srcpos"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MARCCODEPROF" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE=" $PROFILE -pg"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORT_OPT="-c -assume byterecl -safe_cray_ptr -mp1 -WB"
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "OPENMP"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp"
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp-threadprivate=compat"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
# FORT_OPT=" $FORT_OPT -auto "
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -save -zero"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOWT="$FORTLOW"
|
|
||||||
FORTRANT="$FORTRAN"
|
|
||||||
FORTHIGHT="$FORTHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FCOMP -c $FDEFINES "
|
|
||||||
CCMNF="icc -c -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel -Dport2egcs -I$MARC_SOURCE/marctoadams/mnf/include -D_LARGEFILE64_SOURCE"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMUMPS="$FCOMP -fpp $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O1 -fp-model precise $FDEFINES -D_IMPLICITNONE $I8FFLAGS $I8DEFINES $DDM -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include -Dintel_ -DALLOW_NON_INIT -Dmetis -nofor_main"
|
|
||||||
CCMUMPS="icc -c -DAdd_ -Dmetis -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BCSCC="icc -c -O3 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_csrc $CDEFINES $CINCL"
|
|
||||||
NVCC="nvcc -c -O3 -arch sm_20 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_cuda/include -I${MARC_CUDA}/include -I$MARC_SOURCE/mdsrc $I8DEFINES -Xcompiler -fvisibility=hidden -Xcompiler -fPIC $I8DEFINES "
|
|
||||||
NVCCLIB="ar rvl"
|
|
||||||
NVCCLD=icc
|
|
||||||
BCSFORTLOW="$FORTLOW -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTRAN="$FORTRAN -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTHIGH="$FORTHIGH -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH="$BCSFORTHIGH"
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSFORTRAN=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORTHIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the tracer and commnet out the next 5 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# INCLUDEMPI="-I$MPI_ROOT/include64 -I$VT_ROOT/include"
|
|
||||||
# LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
LOAD="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FORTLOW -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRAN="$FORTRAN -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FORTHIGH -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FORTRANMNF -fpp -fPIC"
|
|
||||||
CC="$CC -fPIC"
|
|
||||||
CCMNF="$CCMNF -fPIC"
|
|
||||||
CC_CASI="$CC_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH_CASI -fPIC"
|
|
||||||
LINK_EXE_MARC="-L$MARC_LIB -lmarc -L$MARC_LIB_SHARED -lguide -lpthread"
|
|
||||||
LINK_MARC_DLL="-shared -fPIC"
|
|
||||||
LOAD_DLL=$LOAD
|
|
||||||
LOADT_DLL=$LOADT
|
|
||||||
EXT_DLL="so"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
XLIBS="-L/usr/X11/lib -lX11 "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define archive and ranlib syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
ARC="ar rvl"
|
|
||||||
ARD="ar dvl"
|
|
||||||
ARX="ar xl"
|
|
||||||
RAN=""
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# choose which libraries you want to use ( e.g. blas )
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS="$MARC_LIB/vkisolver.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS="$MARC_CASI/casilib.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS=
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS="$MARC_LIB/mf2parallel/libseq.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libsym.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmet.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libnum.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libutl.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libr8.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libz.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS="$MARC_LIB/libmumps.a"
|
|
||||||
if test $MPITYPE = none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
echo hello > /dev/null
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS=
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcsgpulib.a "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS1="-L${MARC_LIB}/cuda_dummy -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS2="-L${MARC_LIB}/cuda -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS=$MARCCUDALIBS1
|
|
||||||
CUDALIBS="-L$MARC_CUDA/lib64 -lcudart -lcublas -L/usr/lib64 -lcuda "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcslib.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_core.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_core.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SECLIBS="-L$MARC_LIB -llapi"
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS="${BCSSOLVERLIBS} ${VKISOLVERLIBS} ${CASISOLVERLIBS} ${INTELSOLVERLIBS} ${MF2SOLVERLIBS} ${MUMPSSOLVERLIBS2} \
|
|
||||||
$MKLLIB -L$MARC_MKL -liomp5 \
|
|
||||||
$MARC_LIB/blas_src.a ${ACSI_LIB}/ACSI_MarcLib.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS_DLL=${SOLVERLIBS}
|
|
||||||
|
|
||||||
MRCLIBS="$MARC_LIB/clib.a ${CASISOLVERLIBS}"
|
|
||||||
MRCLIBSPAR="$MARC_LIB/clib.a"
|
|
||||||
STUBS="$MARC_LIB/stubs.a "
|
|
||||||
MNFLIBS="$MARC_LIB/libmnf.a"
|
|
||||||
MDUSER="$MARC_LIB/md_user.a"
|
|
||||||
|
|
||||||
OPENMP="-openmp"
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBS=" $OPENMP -lpthread "
|
|
||||||
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the trace and comment out the next 4 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# SYSLIBS="-L${VT_ROOT}/lib -lVT -ldwarf -lelf -lm -lpthread \
|
|
||||||
# -L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt"
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SYSLIBS="-L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt $OPENMP -threads -lpthread"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBSPAR=" "
|
|
||||||
|
|
||||||
MARC_DLL_CODES="runmarc.f"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BLAS_SRC="dzero.f icopy.f izero.f"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
BLAS_SRC="$BLAS_SRC dsctr.f zsctr.f dzasum.f daxpyi.f zaxpyi.f dgthr.f zgthr.f"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BLAS_SRC="ALL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="are163.f contro.f ndext.f omarc.f omarca.f omarcb.f omarcc.f \
|
|
||||||
omars.f fixbc.f triang.f bet049.f norst3.f eldata.f \
|
|
||||||
elec*.f elct*.f fmeig.f oada00.f ogeig.f updtrbe2.f cycrota.f \
|
|
||||||
cordef.f ogpk.f ogtan.f eldam.f formrbe3.f \
|
|
||||||
inertie.f em_sso072.f cn_fol3d_qpatch6.f cosim_begin.f"
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i8" ; then
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="$LOW_OPT_CODES bbcseg.f"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES_CASI=""
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES="dpsmsa1.f dpsmsa2.f dpsmsa3.f dpsmsa4.f dpsmsa5.f dpsmsa6.f \
|
|
||||||
dpsmsa7.f dpsmsa8.f dpsmsa9.f dpsmsa10.f dpsmsa11.f dpsmsa12.f \
|
|
||||||
dpsmsa13.f dpsmsa14.f dpsmsa15.f dpsmsa16.f dpsmsah.f tpsmsah.f cn_qsort4_11.f "
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES_CASI="arithkernels.c blockedroutines.c blockedroutines_fd.c elemmatgenkernels.c longvecroutines.c sfmultutils.c solvewithbd.c"
|
|
||||||
|
|
||||||
MAXNUM=1000000
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,5 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
# This script opens a window running an editor.
|
|
||||||
# The command to invoke the editor is specified during DAMASK installation
|
|
||||||
|
|
||||||
%EDITOR% $*
|
|
||||||
|
|
@ -1,18 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
# This script opens a window running an editor. The default window is an
|
|
||||||
# xterm, and the default editor is vi. These may be customized.
|
|
||||||
|
|
||||||
dir=
|
|
||||||
for d in /usr/bin /usr/bin/X11; do
|
|
||||||
if test -x "$d/xterm"; then
|
|
||||||
dir="$d"
|
|
||||||
break
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
done
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$dir"; then
|
|
||||||
echo "$0: Could not find xterm"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
"$dir/xterm" -T "vi $*" -n "vi $*" -e vi $*
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,186 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
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|
||||||
|
|
||||||
DIR=/msc/marc2014.2
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_marc" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_hmp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_mp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_lmp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_h" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_l" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRAN $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTHIGH $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTHIGHMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTLOW $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRANLOWMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRANMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,41 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user.f on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$FORTRAN $user.f || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user.f"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$user.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $user.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
|
|
@ -1,742 +0,0 @@
|
||||||
#
|
|
||||||
# General definitions for the Marc 2014 version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# EM64T
|
|
||||||
# ( LP64 - i4 version)
|
|
||||||
# (ILP64 - i8 version)
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Linux RedHat 5.7
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# 64 bit MPI version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) Fortran Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) C Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MKL Libraries:
|
|
||||||
# Intel(R) MKL 10.3
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# DATE
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the O/S level, type:
|
|
||||||
# uname -a
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Distributed parallel MPI libraries:
|
|
||||||
# 1) HP MPI 2.3
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
# 2) Intel MPI 4.0
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the Compiler level, type using the compiler
|
|
||||||
# installation path:
|
|
||||||
# ifort -V
|
|
||||||
# icc -V
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# REMARKS : This file contains the definitions of variables used during
|
|
||||||
# compilation loading and use of the MARC programmes . The
|
|
||||||
# current machine type is identified by means of the variable
|
|
||||||
# MACHINE , defined below.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MPI_ROOT: root directory in which mpi shared libraries, etc. are located
|
|
||||||
# DIRJOB : directory in which spawned jobs should look for Marc input
|
|
||||||
# MPI_ARCH: system architecture
|
|
||||||
# MPI_EPATH: path where executable resides
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
REVISION="VERSION, BUILD"
|
|
||||||
HOSTNAME=`hostname`
|
|
||||||
|
|
||||||
# find available memory in Mbyte on the machine
|
|
||||||
# can be set explicitly
|
|
||||||
MEMLIMIT=`free -m | awk '/Mem:/ {print $2}'`
|
|
||||||
|
|
||||||
# set _OEM_NASTRAN to 1 for MD Nastran build
|
|
||||||
# override _OEM_NASTRAN setting with MARC_MD_NASTRAN environment variable
|
|
||||||
_OEM_NASTRAN="${MARC_MD_NASTRAN:-0}"
|
|
||||||
|
|
||||||
# uncomment the following line for an autoforge build
|
|
||||||
#AUTOFORGE=1
|
|
||||||
AUTOFORGE=0
|
|
||||||
export AUTOFORGE
|
|
||||||
|
|
||||||
# integer size
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "" ; then
|
|
||||||
INTEGER_PATH=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTEGER_PATH=/$MARC_INTEGER_SIZE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FCOMP=ifort
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for Metis
|
|
||||||
#
|
|
||||||
METIS="-I$METIS_SOURCE"
|
|
||||||
METISLIBS="$MARC_LIB/metis.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# RCP and RSH are used for parallel network runs
|
|
||||||
# replace with similar commands like rsh if needed
|
|
||||||
RCP=/usr/bin/scp
|
|
||||||
RSH=/usr/bin/ssh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MPI_DEFAULT=intelmpi
|
|
||||||
MPI_OTHER=hpmpi
|
|
||||||
|
|
||||||
MPITYPE=$MPI_DEFAULT
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE = 1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# overrule MPITYPE setting with environmental variable MARC_MPITYPE
|
|
||||||
if test $MARC_MPITYPE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=$MARC_MPITYPE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set MPITYPE to none for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with GPGPU version of BCS Solver for
|
|
||||||
# NVIDIA platforms
|
|
||||||
#BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=BCSGPU
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERFLAGS=
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DBCSGPU -DCUDA"
|
|
||||||
BCS_DIR=bcsgpusolver
|
|
||||||
export PATH=$MARC_CUDA/bin:$MARC_CUDA/nvvm:$PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MARC_CUDA/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCS_DIR=bcssolver
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
DDM=
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpif90
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_HPMPI
|
|
||||||
export MPI_REMSH=$RSH
|
|
||||||
export MPI_F77=$FCOMP
|
|
||||||
ARCHITECTURE=linux_amd64
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include/64 -DDDM -DHPMPI"
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
export MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE:$MARC_LIB:$MARC_LIB_SHARED:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="-e MPI_FLAGS=E,T,y1"
|
|
||||||
# Below line is moved in run_marc file
|
|
||||||
# export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e BINDIR=$MARC_BIN"
|
|
||||||
if test -n "$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MSC_LICENSE_FILE=$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test -n "$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LM_LICENSE_FILE=$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MPI_LIC_CHECKER=$MPI_ROOT/bin/licensing/amd64_s8/lichk.x"
|
|
||||||
RUN_JOB2="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -f "
|
|
||||||
RUN_JOB1="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -w $MPIHPSPECIAL -np "
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
INTELMPI_VERSION=HYDRA
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpiifort
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_INTELMPI
|
|
||||||
DDM="-I${MPI_ROOT}/include64 -DDDM"
|
|
||||||
PATH=$MPI_ROOT/bin64:$PATH
|
|
||||||
export PATH
|
|
||||||
LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
if test $INTELMPI_VERSION = HYDRA
|
|
||||||
then
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -configfile "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
MPIR_HOME=$MPI_ROOT
|
|
||||||
MPICH_F77=$FCOMP
|
|
||||||
MPICH_F77LINKER=$FCOMP
|
|
||||||
export MPI_ROOT MPI_EPATH MPIR_HOME MPICH_F77 MPICH_F77LINKER
|
|
||||||
I_MPI_PIN_DOMAIN=node
|
|
||||||
export I_MPI_PIN_DOMAIN
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# variables for the "maintain" script
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
MACHINENAME=LINUX
|
|
||||||
MACHINE64BIT=yes
|
|
||||||
MACHINE=Linux_EM64T
|
|
||||||
DEV=/dev/tape
|
|
||||||
GETLOG="whoami"
|
|
||||||
CLEAR="clear"
|
|
||||||
MY_UNAME=`uname -a`
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with VKI Solver
|
|
||||||
#VKISOLVER=VKI
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with CASI Solver
|
|
||||||
CASISOLVER=CASI
|
|
||||||
#CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with MF2 Solver
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
#MF2SOLVER=SERIAL
|
|
||||||
#MF2SOLVER=MF2PARALLEL
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with Intel(c) Multithreaded solver (PARDISO)
|
|
||||||
#INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=PARDISO
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with MUMPS
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
else
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build MARC dynamic shared library
|
|
||||||
MARC_DLL=MARC_DLL
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set VKISOLVER, CASISOLVER, BCSGPUSOLVER, and MARC_DLL to NONE for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define Fortran and C compile syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DVKI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DCASI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2PARALLEL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2SERIAL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2SERIAL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DPARDISO"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMUMPS"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMARC_DLL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LINK_OPT=
|
|
||||||
DEBUG_OPT=
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT=
|
|
||||||
|
|
||||||
#Uncomment following line to build Marc in debuggable mode
|
|
||||||
MARCDEBUG=
|
|
||||||
#MARCDEBUG="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LINK_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCHECK=
|
|
||||||
#MARCCHECK="ON"
|
|
||||||
if test "$MARCCHECK" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DEBUG_OPT="$DEBUG_OPT -fpe0 -fp-stack-check -check all -ftrapuv "
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="$C_DEBUG_OPT -fp-stack-check -check-uninit -Wformat -ftrapuv "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODECOV=
|
|
||||||
#MARCCODECOV="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
I8FFLAGS="-real-size 64 -integer-size 32"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DFLOAT=8 -DINT=4"
|
|
||||||
I8CDEFINES=
|
|
||||||
I8CASIDEFS=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
I8FFLAGS="-i8 -real-size 64 -integer-size 64"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DI64 -DFLOAT=8 -DINT=8"
|
|
||||||
I8CDEFINES="-U_DOUBLE -D_SINGLE"
|
|
||||||
I8CASIDEFS="-DCASI_64BIT_INT=1"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MTHREAD=OPENMP
|
|
||||||
if test "$MARC_OPENMP" = "NONE" ; then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#MTHREAD=NONE
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
OMP_COMPAT=YES
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "NONE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CDEFINES=
|
|
||||||
FDEFINES=
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_IMPLICITNONE"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -eq 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DMKL -DOPENMP"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DOMP_COMPAT"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# -D_MSCMARC
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_MSCMARC $DEBUG_OPT"
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_MSCMARC $C_DEBUG_OPT $I8CDEFINES"
|
|
||||||
|
|
||||||
CINCL="-I$MARC_SOURCE/mdsrc -I$MARC_SOURCE/csource $METIS"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CINCL="$CINCL -I../../include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CC="icc -c -O1 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -O0 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -O3 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CC="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOAD_CC="icc -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel"
|
|
||||||
CCT="$CC"
|
|
||||||
CCTLOW="$CCLOW"
|
|
||||||
CCTHIGH="$CCHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
CC_CASI="$CC -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
CCT_CASI="$CCT -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTLOW_CASI="$CCLOW -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTHIGH_CASI="$CCHIGH -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=lines"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func,mpi"
|
|
||||||
PROFILE=
|
|
||||||
if test "$MARCCODECOV" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE="-prof-gen=srcpos"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORT_OPT="-c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr -mp1 -WB"
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "OPENMP"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp"
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp-threadprivate=compat"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
# FORT_OPT=" $FORT_OPT -auto "
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -save -zero"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
# determine DAMASK version
|
|
||||||
HIT=0
|
|
||||||
for arg in "$@"
|
|
||||||
do
|
|
||||||
if [ $HIT = 1 ]
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DAMASKPATH=`dirname $arg`
|
|
||||||
break
|
|
||||||
elif [ ${arg:0:2} = -u -o ${arg:0:2} = -U ]
|
|
||||||
then
|
|
||||||
HIT=1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
done
|
|
||||||
read DAMASKVERSION < $DAMASKPATH/../VERSION
|
|
||||||
DAMASKVERSION="'"$DAMASKVERSION"'"
|
|
||||||
|
|
||||||
# DAMASK compiler calls: additional flags are in line 2 OpenMP flags in line 3
|
|
||||||
DFORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTLOWMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRANMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O2 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGHMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -fno-alias -O2 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
# DAMASK compiler calls: additional flags are in line 2 OpenMP flags in line 3
|
|
||||||
DFORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTLOWMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRANMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGHMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2014 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOWT="$FORTLOW"
|
|
||||||
FORTRANT="$FORTRAN"
|
|
||||||
FORTHIGHT="$FORTHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FCOMP -c $FDEFINES "
|
|
||||||
CCMNF="icc -c -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel -Dport2egcs -I$MARC_SOURCE/marctoadams/mnf/include -D_LARGEFILE64_SOURCE"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMUMPS="$FCOMP -fpp $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O1 -fp-model precise $FDEFINES -D_IMPLICITNONE $I8FFLAGS $I8DEFINES $DDM -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include -Dintel_ -DALLOW_NON_INIT -Dmetis -nofor_main"
|
|
||||||
CCMUMPS="icc -c -DAdd_ -Dmetis -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BCSCC="icc -c -O3 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_csrc $CDEFINES $CINCL"
|
|
||||||
NVCC="nvcc -c -O3 -arch sm_20 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_cuda/include -I${MARC_CUDA}/include -I$MARC_SOURCE/mdsrc $I8DEFINES -Xcompiler -fvisibility=hidden -Xcompiler -fPIC $I8DEFINES "
|
|
||||||
NVCCLIB="ar rvl"
|
|
||||||
NVCCLD=icc
|
|
||||||
BCSFORTLOW="$FORTLOW -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTRAN="$FORTRAN -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTHIGH="$FORTHIGH -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH="$BCSFORTHIGH"
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSFORTRAN=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORTHIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the tracer and commnet out the next 5 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# INCLUDEMPI="-I$MPI_ROOT/include64 -I$VT_ROOT/include"
|
|
||||||
# LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
LOAD="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FORTLOW -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRAN="$FORTRAN -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FORTHIGH -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FORTRANMNF -fpp -fPIC"
|
|
||||||
CC="$CC -fPIC"
|
|
||||||
CCMNF="$CCMNF -fPIC"
|
|
||||||
CC_CASI="$CC_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH_CASI -fPIC"
|
|
||||||
LINK_EXE_MARC="-L$MARC_LIB -lmarc -L$MARC_LIB_SHARED -lguide -lpthread"
|
|
||||||
LINK_MARC_DLL="-shared -fPIC"
|
|
||||||
LOAD_DLL=$LOAD
|
|
||||||
LOADT_DLL=$LOADT
|
|
||||||
EXT_DLL="so"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
XLIBS="-L/usr/X11/lib -lX11 "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define archive and ranlib syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
ARC="ar rvl"
|
|
||||||
ARD="ar dvl"
|
|
||||||
ARX="ar xl"
|
|
||||||
RAN=""
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# choose which libraries you want to use ( e.g. blas )
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS="$MARC_LIB/vkisolver.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS="$MARC_LIB/casilib.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS=
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS="$MARC_LIB/mf2parallel/libseq.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libsym.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmet.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libnum.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libutl.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libr8.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libz.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS="$MARC_LIB/libmumps.a"
|
|
||||||
if test $MPITYPE = none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
echo hello > /dev/null
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS=
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcsgpulib.a "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS1="-L${MARC_LIB}/cuda_dummy -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS2="-L${MARC_LIB}/cuda -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS=$MARCCUDALIBS1
|
|
||||||
CUDALIBS="-L$MARC_CUDA/lib64 -lcudart -lcublas -L/usr/lib64 -lcuda "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcslib.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_lp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_core.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_ilp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_core.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SECLIBS="-L$MARC_LIB -llapi"
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS="${BCSSOLVERLIBS} \
|
|
||||||
${INTELSOLVERLIBS} ${MF2SOLVERLIBS} -Wl,--start-group $MKLLIB ${MUMPSSOLVERLIBS2} \
|
|
||||||
$MARC_MKL/libiomp5.a -Wl,--end-group \
|
|
||||||
$MARC_LIB/blas_src.a ${VKISOLVERLIBS} ${CASISOLVERLIBS} "
|
|
||||||
SOLVERLIBS_DLL=${SOLVERLIBS}
|
|
||||||
|
|
||||||
MRCLIBS="$MARC_LIB/clib.a ${CASISOLVERLIBS}"
|
|
||||||
MRCLIBSPAR="$MARC_LIB/clib.a"
|
|
||||||
STUBS="$MARC_LIB/stubs.a "
|
|
||||||
MNFLIBS="$MARC_LIB/libmnf.a"
|
|
||||||
MDUSER="$MARC_LIB/md_user.a"
|
|
||||||
|
|
||||||
OPENMP="-openmp"
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBS=" $OPENMP -lpthread "
|
|
||||||
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the trace and comment out the next 4 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# SYSLIBS="-L${VT_ROOT}/lib -lVT -ldwarf -lelf -lm -lpthread \
|
|
||||||
# -L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt"
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SYSLIBS="-L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt $OPENMP -threads -lpthread"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBSPAR=" "
|
|
||||||
|
|
||||||
MARC_DLL_CODES="runmarc.f"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BLAS_SRC="dzero.f icopy.f izero.f"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
BLAS_SRC="$BLAS_SRC dsctr.f zsctr.f dzasum.f daxpyi.f zaxpyi.f dgthr.f zgthr.f"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BLAS_SRC="ALL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="are163.f contro.f ndext.f omarc.f omarca.f omarcb.f omarcc.f \
|
|
||||||
omars.f fixbc.f triang.f bet049.f norst3.f eldata.f \
|
|
||||||
elec*.f elct*.f fmeig.f oada00.f ogeig.f updtrbe2.f cycrota.f \
|
|
||||||
cordef.f ogpk.f ogtan.f eldam.f formrbe3.f \
|
|
||||||
inertie.f em_sso072.f cn_fol3d_qpatch6.f"
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i8" ; then
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="$LOW_OPT_CODES bbcseg.f"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES_CASI=""
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES="dpsmsa1.f dpsmsa2.f dpsmsa3.f dpsmsa4.f dpsmsa5.f dpsmsa6.f \
|
|
||||||
dpsmsa7.f dpsmsa8.f dpsmsa9.f dpsmsa10.f dpsmsa11.f dpsmsa12.f \
|
|
||||||
dpsmsa13.f dpsmsa14.f dpsmsa15.f dpsmsa16.f cn_qsort4_11.f "
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES_CASI="arithkernels.c blockedroutines.c blockedroutines_fd.c elemmatgenkernels.c longvecroutines.c sfmultutils.c solvewithbd.c"
|
|
||||||
|
|
||||||
MAXNUM=1000000
|
|
||||||
|
|
@ -1,679 +0,0 @@
|
||||||
#
|
|
||||||
# General definitions for the Marc 2014 version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# EM64T
|
|
||||||
# ( LP64 - i4 version)
|
|
||||||
# (ILP64 - i8 version)
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Linux RedHat 5.7
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# 64 bit MPI version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) Fortran Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) C Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MKL Libraries:
|
|
||||||
# Intel(R) MKL 10.3
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# DATE
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the O/S level, type:
|
|
||||||
# uname -a
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Distributed parallel MPI libraries:
|
|
||||||
# 1) HP MPI 2.3
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
# 2) Intel MPI 4.0
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the Compiler level, type using the compiler
|
|
||||||
# installation path:
|
|
||||||
# ifort -V
|
|
||||||
# icc -V
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# REMARKS : This file contains the definitions of variables used during
|
|
||||||
# compilation loading and use of the MARC programmes . The
|
|
||||||
# current machine type is identified by means of the variable
|
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# MACHINE , defined below.
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#
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#
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# MPI_ROOT: root directory in which mpi shared libraries, etc. are located
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# DIRJOB : directory in which spawned jobs should look for Marc input
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# MPI_ARCH: system architecture
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# MPI_EPATH: path where executable resides
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#
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||||||
REVISION="VERSION, BUILD"
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||||||
HOSTNAME=`hostname`
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||||||
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||||||
# find available memory in Mbyte on the machine
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||||||
# can be set explicitly
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||||||
MEMLIMIT=`free -m | awk '/Mem:/ {print $2}'`
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||||||
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||||||
# set _OEM_NASTRAN to 1 for MD Nastran build
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||||||
# override _OEM_NASTRAN setting with MARC_MD_NASTRAN environment variable
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||||||
_OEM_NASTRAN="${MARC_MD_NASTRAN:-0}"
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||||||
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||||||
# uncomment the following line for an autoforge build
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#AUTOFORGE=1
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||||||
AUTOFORGE=0
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||||||
export AUTOFORGE
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||||||
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||||||
# integer size
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||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "" ; then
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||||||
INTEGER_PATH=
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|
||||||
else
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|
||||||
INTEGER_PATH=/$MARC_INTEGER_SIZE
|
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||||||
fi
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||||||
|
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||||||
FCOMP=ifort
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||||||
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||||||
#
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||||||
# settings for Metis
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#
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||||||
METIS="-I$METIS_SOURCE"
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||||||
METISLIBS="$MARC_LIB/metis.a "
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||||||
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#
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||||||
# settings for MPI
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||||||
#
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||||||
# RCP and RSH are used for parallel network runs
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||||||
# replace with similar commands like rsh if needed
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RCP=/usr/bin/scp
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||||||
RSH=/usr/bin/ssh
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||||||
#
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||||||
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||||||
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||||||
MPI_DEFAULT=intelmpi
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||||||
MPI_OTHER=hpmpi
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||||||
MPITYPE=$MPI_DEFAULT
|
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||||||
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||||||
if test $AUTOFORGE
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|
||||||
then
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||||||
if test $AUTOFORGE = 1
|
|
||||||
then
|
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||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
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||||||
# overrule MPITYPE setting with environmental variable MARC_MPITYPE
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||||||
if test $MARC_MPITYPE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=$MARC_MPITYPE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
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||||||
# always set MPITYPE to none for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
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||||||
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||||||
# Edit following lines to build with GPGPU version of BCS Solver for
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||||||
# NVIDIA platforms
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||||||
#BCSGPUSOLVER=NONE
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||||||
BCSGPUSOLVER=BCSGPU
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||||||
|
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||||||
SOLVERFLAGS=
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|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DBCSGPU -DCUDA"
|
|
||||||
BCS_DIR=bcsgpusolver
|
|
||||||
export PATH=$MARC_CUDA/bin:$MARC_CUDA/nvvm:$PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MARC_CUDA/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCS_DIR=bcssolver
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
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|
||||||
#
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||||||
DDM=
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpif90
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_HPMPI
|
|
||||||
export MPI_REMSH=$RSH
|
|
||||||
export MPI_F77=$FCOMP
|
|
||||||
ARCHITECTURE=linux_amd64
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include/64 -DDDM -DHPMPI"
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
export MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE:$MARC_LIB:$MARC_LIB_SHARED:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="-e MPI_FLAGS=E,T,y1"
|
|
||||||
# Below line is moved in run_marc file
|
|
||||||
# export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e BINDIR=$MARC_BIN"
|
|
||||||
if test -n "$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MSC_LICENSE_FILE=$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test -n "$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LM_LICENSE_FILE=$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MPI_LIC_CHECKER=$MPI_ROOT/bin/licensing/amd64_s8/lichk.x"
|
|
||||||
RUN_JOB2="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -f "
|
|
||||||
RUN_JOB1="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -w $MPIHPSPECIAL -np "
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
INTELMPI_VERSION=HYDRA
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpiifort
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_INTELMPI
|
|
||||||
DDM="-I${MPI_ROOT}/include64 -DDDM"
|
|
||||||
PATH=$MPI_ROOT/bin64:$PATH
|
|
||||||
export PATH
|
|
||||||
LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
if test $INTELMPI_VERSION = HYDRA
|
|
||||||
then
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -configfile "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
MPIR_HOME=$MPI_ROOT
|
|
||||||
MPICH_F77=$FCOMP
|
|
||||||
MPICH_F77LINKER=$FCOMP
|
|
||||||
export MPI_ROOT MPI_EPATH MPIR_HOME MPICH_F77 MPICH_F77LINKER
|
|
||||||
I_MPI_PIN_DOMAIN=node
|
|
||||||
export I_MPI_PIN_DOMAIN
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
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||||||
# variables for the "maintain" script
|
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||||||
#
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||||||
|
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||||||
MACHINENAME=LINUX
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|
||||||
MACHINE64BIT=yes
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||||||
MACHINE=Linux_EM64T
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||||||
DEV=/dev/tape
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||||||
GETLOG="whoami"
|
|
||||||
CLEAR="clear"
|
|
||||||
MY_UNAME=`uname -a`
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||||||
|
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||||||
# Edit following 2 lines to build with VKI Solver
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||||||
#VKISOLVER=VKI
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||||||
VKISOLVER=NONE
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||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with CASI Solver
|
|
||||||
CASISOLVER=CASI
|
|
||||||
#CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with MF2 Solver
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
#MF2SOLVER=SERIAL
|
|
||||||
#MF2SOLVER=MF2PARALLEL
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with Intel(c) Multithreaded solver (PARDISO)
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||||||
#INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=PARDISO
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with MUMPS
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||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
else
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build MARC dynamic shared library
|
|
||||||
MARC_DLL=MARC_DLL
|
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||||||
MARC_DLL=NONE
|
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||||||
|
|
||||||
# always set VKISOLVER, CASISOLVER, BCSGPUSOLVER, and MARC_DLL to NONE for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define Fortran and C compile syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DVKI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DCASI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2PARALLEL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2SERIAL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2SERIAL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DPARDISO"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMUMPS"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMARC_DLL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LINK_OPT=
|
|
||||||
DEBUG_OPT=
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT=
|
|
||||||
|
|
||||||
#Uncomment following line to build Marc in debuggable mode
|
|
||||||
MARCDEBUG=
|
|
||||||
#MARCDEBUG="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LINK_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCHECK=
|
|
||||||
#MARCCHECK="ON"
|
|
||||||
if test "$MARCCHECK" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DEBUG_OPT="$DEBUG_OPT -fpe0 -fp-stack-check -check all -ftrapuv "
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="$C_DEBUG_OPT -fp-stack-check -check-uninit -Wformat -ftrapuv "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODECOV=
|
|
||||||
#MARCCODECOV="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
I8FFLAGS=
|
|
||||||
I8DEFINES=
|
|
||||||
I8CDEFINES=
|
|
||||||
I8CASIDEFS=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
I8FFLAGS="-i8"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DI64"
|
|
||||||
I8CDEFINES="-U_DOUBLE -D_SINGLE"
|
|
||||||
I8CASIDEFS="-DCASI_64BIT_INT=1"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MTHREAD=OPENMP
|
|
||||||
if test "$MARC_OPENMP" = "NONE" ; then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#MTHREAD=NONE
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
OMP_COMPAT=YES
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "NONE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CDEFINES=
|
|
||||||
FDEFINES=
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_IMPLICITNONE"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -eq 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DMKL -DOPENMP"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DOMP_COMPAT"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# -D_MSCMARC
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_MSCMARC $DEBUG_OPT"
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_MSCMARC $C_DEBUG_OPT $I8CDEFINES"
|
|
||||||
|
|
||||||
CINCL="-I$MARC_SOURCE/mdsrc -I$MARC_SOURCE/csource $METIS"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CINCL="$CINCL -I../../include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CC="icc -c -O1 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -O0 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -O3 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CC="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOAD_CC="icc -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel"
|
|
||||||
CCT="$CC"
|
|
||||||
CCTLOW="$CCLOW"
|
|
||||||
CCTHIGH="$CCHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
CC_CASI="$CC -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
CCT_CASI="$CCT -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTLOW_CASI="$CCLOW -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTHIGH_CASI="$CCHIGH -c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=lines"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func,mpi"
|
|
||||||
PROFILE=
|
|
||||||
if test "$MARCCODECOV" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE="-prof-gen=srcpos"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORT_OPT="-c -assume byterecl -safe_cray_ptr -mp1 -WB"
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "OPENMP"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp"
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp-threadprivate=compat"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
# FORT_OPT=" $FORT_OPT -auto "
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -save -zero"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOWT="$FORTLOW"
|
|
||||||
FORTRANT="$FORTRAN"
|
|
||||||
FORTHIGHT="$FORTHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FCOMP -c $FDEFINES "
|
|
||||||
CCMNF="icc -c -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel -Dport2egcs -I$MARC_SOURCE/marctoadams/mnf/include -D_LARGEFILE64_SOURCE"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMUMPS="$FCOMP -fpp $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O1 -fp-model precise $FDEFINES -D_IMPLICITNONE $I8FFLAGS $I8DEFINES $DDM -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include -Dintel_ -DALLOW_NON_INIT -Dmetis -nofor_main"
|
|
||||||
CCMUMPS="icc -c -DAdd_ -Dmetis -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BCSCC="icc -c -O3 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_csrc $CDEFINES $CINCL"
|
|
||||||
NVCC="nvcc -c -O3 -arch sm_20 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_cuda/include -I${MARC_CUDA}/include -I$MARC_SOURCE/mdsrc $I8DEFINES -Xcompiler -fvisibility=hidden -Xcompiler -fPIC $I8DEFINES "
|
|
||||||
NVCCLIB="ar rvl"
|
|
||||||
NVCCLD=icc
|
|
||||||
BCSFORTLOW="$FORTLOW -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTRAN="$FORTRAN -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTHIGH="$FORTHIGH -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH="$BCSFORTHIGH"
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSFORTRAN=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORTHIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the tracer and commnet out the next 5 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# INCLUDEMPI="-I$MPI_ROOT/include64 -I$VT_ROOT/include"
|
|
||||||
# LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
LOAD="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FORTLOW -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRAN="$FORTRAN -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FORTHIGH -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FORTRANMNF -fpp -fPIC"
|
|
||||||
CC="$CC -fPIC"
|
|
||||||
CCMNF="$CCMNF -fPIC"
|
|
||||||
CC_CASI="$CC_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH_CASI -fPIC"
|
|
||||||
LINK_EXE_MARC="-L$MARC_LIB -lmarc -L$MARC_LIB_SHARED -lguide -lpthread"
|
|
||||||
LINK_MARC_DLL="-shared -fPIC"
|
|
||||||
LOAD_DLL=$LOAD
|
|
||||||
LOADT_DLL=$LOADT
|
|
||||||
EXT_DLL="so"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
XLIBS="-L/usr/X11/lib -lX11 "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define archive and ranlib syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
ARC="ar rvl"
|
|
||||||
ARD="ar dvl"
|
|
||||||
ARX="ar xl"
|
|
||||||
RAN=""
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# choose which libraries you want to use ( e.g. blas )
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS="$MARC_LIB/vkisolver.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS="$MARC_LIB/casilib.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS=
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS="$MARC_LIB/mf2parallel/libseq.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libsym.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmet.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libnum.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libutl.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libr8.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libz.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS="$MARC_LIB/libmumps.a"
|
|
||||||
if test $MPITYPE = none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
echo hello > /dev/null
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS=
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcsgpulib.a "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS1="-L${MARC_LIB}/cuda_dummy -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS2="-L${MARC_LIB}/cuda -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS=$MARCCUDALIBS1
|
|
||||||
CUDALIBS="-L$MARC_CUDA/lib64 -lcudart -lcublas -L/usr/lib64 -lcuda "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcslib.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_scalapack_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_core.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_scalapack_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_core.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SECLIBS="-L$MARC_LIB -llapi"
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS="${BCSSOLVERLIBS} \
|
|
||||||
${INTELSOLVERLIBS} ${MF2SOLVERLIBS} -Wl,--start-group $MKLLIB ${MUMPSSOLVERLIBS2} \
|
|
||||||
$MARC_MKL/libiomp5.a -Wl,--end-group \
|
|
||||||
$MARC_LIB/blas_src.a ${VKISOLVERLIBS} ${CASISOLVERLIBS} "
|
|
||||||
SOLVERLIBS_DLL=${SOLVERLIBS}
|
|
||||||
|
|
||||||
MRCLIBS="$MARC_LIB/clib.a ${CASISOLVERLIBS}"
|
|
||||||
MRCLIBSPAR="$MARC_LIB/clib.a"
|
|
||||||
STUBS="$MARC_LIB/stubs.a "
|
|
||||||
MNFLIBS="$MARC_LIB/libmnf.a"
|
|
||||||
MDUSER="$MARC_LIB/md_user.a"
|
|
||||||
|
|
||||||
OPENMP="-openmp"
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBS=" $OPENMP -lpthread "
|
|
||||||
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the trace and comment out the next 4 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# SYSLIBS="-L${VT_ROOT}/lib -lVT -ldwarf -lelf -lm -lpthread \
|
|
||||||
# -L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt"
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SYSLIBS="-L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt $OPENMP -threads -lpthread"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBSPAR=" "
|
|
||||||
|
|
||||||
MARC_DLL_CODES="runmarc.f"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BLAS_SRC="dzero.f icopy.f izero.f"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
BLAS_SRC="$BLAS_SRC dsctr.f zsctr.f dzasum.f daxpyi.f zaxpyi.f dgthr.f zgthr.f"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BLAS_SRC="ALL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="are163.f contro.f ndext.f omarc.f omarca.f omarcb.f omarcc.f \
|
|
||||||
omars.f fixbc.f triang.f bet049.f norst3.f eldata.f \
|
|
||||||
elec*.f elct*.f fmeig.f oada00.f ogeig.f updtrbe2.f cycrota.f \
|
|
||||||
cordef.f ogpk.f ogtan.f eldam.f formrbe3.f \
|
|
||||||
inertie.f em_sso072.f cn_fol3d_qpatch6.f"
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i8" ; then
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="$LOW_OPT_CODES bbcseg.f"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES_CASI=""
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES="dpsmsa1.f dpsmsa2.f dpsmsa3.f dpsmsa4.f dpsmsa5.f dpsmsa6.f \
|
|
||||||
dpsmsa7.f dpsmsa8.f dpsmsa9.f dpsmsa10.f dpsmsa11.f dpsmsa12.f \
|
|
||||||
dpsmsa13.f dpsmsa14.f dpsmsa15.f dpsmsa16.f cn_qsort4_11.f "
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES_CASI="arithkernels.c blockedroutines.c blockedroutines_fd.c elemmatgenkernels.c longvecroutines.c sfmultutils.c solvewithbd.c"
|
|
||||||
|
|
||||||
MAXNUM=1000000
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,5 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
# This script opens a window running an editor.
|
|
||||||
# The command to invoke the editor is specified during DAMASK installation
|
|
||||||
|
|
||||||
%EDITOR% $*
|
|
||||||
|
|
@ -1,18 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
# This script opens a window running an editor. The default window is an
|
|
||||||
# xterm, and the default editor is vi. These may be customized.
|
|
||||||
|
|
||||||
dir=
|
|
||||||
for d in /usr/bin /usr/bin/X11; do
|
|
||||||
if test -x "$d/xterm"; then
|
|
||||||
dir="$d"
|
|
||||||
break
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
done
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$dir"; then
|
|
||||||
echo "$0: Could not find xterm"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
"$dir/xterm" -T "vi $*" -n "vi $*" -e vi $*
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,186 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=/nethome/storage/raid3/f.roters/temp/msc/marc2014
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_marc" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_hmp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_mp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_lmp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_h" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_l" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRAN $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTHIGH $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTHIGHMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTLOW $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRANLOWMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,52 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
usernoext=$user
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .F`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .for`
|
|
||||||
usernoext=`dirname $usernoext`/`$BASENAME $usernoext .f90`
|
|
||||||
|
|
||||||
# add BLAS options for linking
|
|
||||||
BLAS="%BLAS%"
|
|
||||||
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$DFORTRANMP $user || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$usernoext.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$BLAS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $usernoext.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
/bin/rm $DIRJOB/*.mod
|
|
||||||
|
|
@ -1,41 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/ksh
|
|
||||||
# 1st arg: $DIR
|
|
||||||
# 2nd arg: $DIRJOB
|
|
||||||
# 3rd arg: $user
|
|
||||||
# 4th arg: $program
|
|
||||||
DIR=$1
|
|
||||||
user=$3
|
|
||||||
program=$4
|
|
||||||
. $DIR/tools/include
|
|
||||||
DIRJOB=$2
|
|
||||||
cd $DIRJOB
|
|
||||||
echo "Compiling and linking user subroutine $user.f on host `hostname`"
|
|
||||||
echo "program: $program"
|
|
||||||
$FORTRAN $user.f || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: compile failed for $user.f"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $program 2>/dev/null
|
|
||||||
userobj=$user.o
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
$LOAD ${program} $DIR/lib/main.o\
|
|
||||||
$DIR/lib/blkdta.o $DIR/lib/comm?.o \
|
|
||||||
${userobj-} \
|
|
||||||
$DIR/lib/srclib.a \
|
|
||||||
$MNFLIBS \
|
|
||||||
$MDUSER \
|
|
||||||
../lib/mdsrc.a \
|
|
||||||
../lib/mcvfit.a \
|
|
||||||
$STUBS \
|
|
||||||
${SOLVERLIBS} \
|
|
||||||
$TKLIBS \
|
|
||||||
$MRCLIBS \
|
|
||||||
$METISLIBS \
|
|
||||||
$SYSLIBS || \
|
|
||||||
{
|
|
||||||
echo "$0: link failed for $user.o on host `hostname`"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/bin/rm $userobj
|
|
||||||
|
|
@ -1,744 +0,0 @@
|
||||||
#
|
|
||||||
# General definitions for the Marc 2014 version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# EM64T
|
|
||||||
# ( LP64 - i4 version)
|
|
||||||
# (ILP64 - i8 version)
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Linux RedHat 5.7
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# 64 bit MPI version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) Fortran Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) C Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MKL Libraries:
|
|
||||||
# Intel(R) MKL 10.3
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# DATE
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the O/S level, type:
|
|
||||||
# uname -a
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Distributed parallel MPI libraries:
|
|
||||||
# 1) HP MPI 2.3
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
# 2) Intel MPI 4.0
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the Compiler level, type using the compiler
|
|
||||||
# installation path:
|
|
||||||
# ifort -V
|
|
||||||
# icc -V
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# REMARKS : This file contains the definitions of variables used during
|
|
||||||
# compilation loading and use of the MARC programmes . The
|
|
||||||
# current machine type is identified by means of the variable
|
|
||||||
# MACHINE , defined below.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MPI_ROOT: root directory in which mpi shared libraries, etc. are located
|
|
||||||
# DIRJOB : directory in which spawned jobs should look for Marc input
|
|
||||||
# MPI_ARCH: system architecture
|
|
||||||
# MPI_EPATH: path where executable resides
|
|
||||||
#
|
|
||||||
REVISION="VERSION, BUILD"
|
|
||||||
HOSTNAME=`hostname`
|
|
||||||
|
|
||||||
# find available memory in Mbyte on the machine
|
|
||||||
# can be set explicitly
|
|
||||||
MEMLIMIT=`free -m | awk '/Mem:/ {print $2}'`
|
|
||||||
|
|
||||||
# set _OEM_NASTRAN to 1 for MD Nastran build
|
|
||||||
# override _OEM_NASTRAN setting with MARC_MD_NASTRAN environment variable
|
|
||||||
_OEM_NASTRAN="${MARC_MD_NASTRAN:-0}"
|
|
||||||
|
|
||||||
# uncomment the following line for an autoforge build
|
|
||||||
#AUTOFORGE=1
|
|
||||||
AUTOFORGE=0
|
|
||||||
export AUTOFORGE
|
|
||||||
|
|
||||||
# integer size
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "" ; then
|
|
||||||
INTEGER_PATH=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTEGER_PATH=/$MARC_INTEGER_SIZE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FCOMP=ifort
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for Metis
|
|
||||||
#
|
|
||||||
METIS="-I$METIS_SOURCE/include"
|
|
||||||
METISLIBS="$MARC_LIB/metis.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# RCP and RSH are used for parallel network runs
|
|
||||||
# replace with similar commands like rsh if needed
|
|
||||||
RCP=/usr/bin/scp
|
|
||||||
RSH=/usr/bin/ssh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MPI_DEFAULT=intelmpi
|
|
||||||
MPI_OTHER=hpmpi
|
|
||||||
|
|
||||||
MPITYPE=$MPI_DEFAULT
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE = 1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# overrule MPITYPE setting with environmental variable MARC_MPITYPE
|
|
||||||
if test $MARC_MPITYPE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=$MARC_MPITYPE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set MPITYPE to none for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with GPGPU version of BCS Solver for
|
|
||||||
# NVIDIA platforms
|
|
||||||
#BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=BCSGPU
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERFLAGS=
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DBCSGPU -DCUDA"
|
|
||||||
BCS_DIR=bcsgpusolver
|
|
||||||
export PATH=$MARC_CUDA/bin:$MARC_CUDA/nvvm:$PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MARC_CUDA/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCS_DIR=bcssolver
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
DDM=
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpif90
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_HPMPI
|
|
||||||
export MPI_REMSH=$RSH
|
|
||||||
export MPI_F77=$FCOMP
|
|
||||||
ARCHITECTURE=linux_amd64
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include/64 -DDDM -DHPMPI"
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
export MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE:$MARC_LIB:$MARC_LIB_SHARED:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="-e MPI_FLAGS=E,T,y1"
|
|
||||||
# Below line is moved in run_marc file
|
|
||||||
# export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e BINDIR=$MARC_BIN"
|
|
||||||
if test -n "$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MSC_LICENSE_FILE=$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test -n "$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LM_LICENSE_FILE=$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MPI_LIC_CHECKER=$MPI_ROOT/bin/licensing/amd64_s8/lichk.x"
|
|
||||||
RUN_JOB2="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -f "
|
|
||||||
RUN_JOB1="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -w $MPIHPSPECIAL -np "
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
INTELMPI_VERSION=HYDRA
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpiifort
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_INTELMPI
|
|
||||||
DDM="-I${MPI_ROOT}/include64 -DDDM"
|
|
||||||
PATH=$MPI_ROOT/bin64:$PATH
|
|
||||||
export PATH
|
|
||||||
LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
if test $INTELMPI_VERSION = HYDRA
|
|
||||||
then
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -configfile "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
MPIR_HOME=$MPI_ROOT
|
|
||||||
MPICH_F77=$FCOMP
|
|
||||||
MPICH_F77LINKER=$FCOMP
|
|
||||||
export MPI_ROOT MPI_EPATH MPIR_HOME MPICH_F77 MPICH_F77LINKER
|
|
||||||
I_MPI_PIN_DOMAIN=node
|
|
||||||
export I_MPI_PIN_DOMAIN
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# variables for the "maintain" script
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
MACHINENAME=LINUX
|
|
||||||
MACHINE64BIT=yes
|
|
||||||
MACHINE=Linux_EM64T
|
|
||||||
DEV=/dev/tape
|
|
||||||
GETLOG="whoami"
|
|
||||||
CLEAR="clear"
|
|
||||||
MY_UNAME=`uname -a`
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with VKI Solver
|
|
||||||
#VKISOLVER=VKI
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with CASI Solver
|
|
||||||
CASISOLVER=CASI
|
|
||||||
if test "$MARC_CASISOLVER" = "NONE" ; then
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with MF2 Solver
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
#MF2SOLVER=SERIAL
|
|
||||||
#MF2SOLVER=MF2PARALLEL
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with Intel(c) Multithreaded solver (PARDISO)
|
|
||||||
#INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=PARDISO
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with MUMPS
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
else
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build MARC dynamic shared library
|
|
||||||
MARC_DLL=MARC_DLL
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set VKISOLVER, CASISOLVER, BCSGPUSOLVER, and MARC_DLL to NONE for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define Fortran and C compile syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DVKI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DCASI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2PARALLEL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2SERIAL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2SERIAL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DPARDISO"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMUMPS"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMARC_DLL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LINK_OPT=
|
|
||||||
DEBUG_OPT=
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT=
|
|
||||||
|
|
||||||
#Uncomment following line to build Marc in debuggable mode
|
|
||||||
MARCDEBUG=
|
|
||||||
#MARCDEBUG="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LINK_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCHECK=
|
|
||||||
#MARCCHECK="ON"
|
|
||||||
if test "$MARCCHECK" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DEBUG_OPT="$DEBUG_OPT -fpe0 -fp-stack-check -check all -ftrapuv "
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="$C_DEBUG_OPT -fp-stack-check -check-uninit -Wformat -ftrapuv "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODECOV=
|
|
||||||
#MARCCODECOV="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODEPROF=
|
|
||||||
#MARCCODEPROF="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
I8FFLAGS="-real-size 64 -integer-size 32"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DFLOAT=8 -DINT=4"
|
|
||||||
I8CDEFINES=
|
|
||||||
I8CASIDEFS=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
I8FFLAGS="-i8 -real-size 64 -integer-size 64"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DI64 -DFLOAT=8 -DINT=8"
|
|
||||||
I8CDEFINES="-U_DOUBLE -D_SINGLE"
|
|
||||||
I8CASIDEFS="-DCASI_64BIT_INT=1"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MTHREAD=OPENMP
|
|
||||||
if test "$MARC_OPENMP" = "NONE" ; then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#MTHREAD=NONE
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
OMP_COMPAT=YES
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "NONE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CDEFINES=
|
|
||||||
FDEFINES=
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_IMPLICITNONE"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -eq 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DMKL -DOPENMP"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DOMP_COMPAT"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# -D_MSCMARC
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_MSCMARC $DEBUG_OPT"
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_MSCMARC $C_DEBUG_OPT $I8CDEFINES"
|
|
||||||
|
|
||||||
CINCL="-I$MARC_SOURCE/mdsrc -I$MARC_SOURCE/csource $METIS"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CINCL="$CINCL -I../../include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CC="icc -c -O1 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -O0 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -O3 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CC="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOAD_CC="icc -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel"
|
|
||||||
CCT="$CC"
|
|
||||||
CCTLOW="$CCLOW"
|
|
||||||
CCTHIGH="$CCHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
CC_CASI="$CC -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
CCT_CASI="$CCT -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=lines"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func,mpi"
|
|
||||||
PROFILE=
|
|
||||||
if test "$MARCCODECOV" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE="-prof-gen=srcpos"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MARCCODEPROF" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE=" $PROFILE -pg"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORT_OPT="-c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr -mp1 -WB"
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "OPENMP"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp"
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp-threadprivate=compat"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
# FORT_OPT=" $FORT_OPT -auto "
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -save -zero"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
# determine DAMASK version
|
|
||||||
if test -n "$DAMASK_USER"; then
|
|
||||||
DAMASKROOT=`dirname $DAMASK_USER`/..
|
|
||||||
read DAMASKVERSION < $DAMASKROOT/VERSION
|
|
||||||
DAMASKVERSION="'"$DAMASKVERSION"'"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
DAMASKVERSION="'N/A'"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# DAMASK compiler calls: additional flags are in line 2 OpenMP flags in line 3
|
|
||||||
DFORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTLOWMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRANMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O2 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGHMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -fno-alias -O2 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
# DAMASK compiler calls: additional flags are in line 2 OpenMP flags in line 3
|
|
||||||
DFORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTLOWMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTRANMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-enable sc3 -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
DFORTHIGHMP="$FCOMP -c -implicitnone -stand f08 -standard-semantics -assume nostd_mod_proc_name -safe_cray_ptr $PROFILE -zero -mp1 -WB -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-fpp -ftz -diag-disable 5268 -warn declarations -warn general -warn usage -warn interfaces -warn ignore_loc -warn alignments -DMarc4DAMASK=2015 -DDAMASKVERSION=$DAMASKVERSION \
|
|
||||||
-openmp -openmp_report2 -openmp-threadprivate=compat\
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOWT="$FORTLOW"
|
|
||||||
FORTRANT="$FORTRAN"
|
|
||||||
FORTHIGHT="$FORTHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FCOMP -c $FDEFINES "
|
|
||||||
CCMNF="icc -c -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel -Dport2egcs -I$MARC_SOURCE/marctoadams/mnf/include -D_LARGEFILE64_SOURCE"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMUMPS="$FCOMP -fpp $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O1 -fp-model precise $FDEFINES -D_IMPLICITNONE $I8FFLAGS $I8DEFINES $DDM -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include -Dintel_ -DALLOW_NON_INIT -Dmetis -nofor_main"
|
|
||||||
CCMUMPS="icc -c -DAdd_ -Dmetis -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BCSCC="icc -c -O3 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_csrc $CDEFINES $CINCL"
|
|
||||||
NVCC="nvcc -c -O3 -arch sm_20 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_cuda/include -I${MARC_CUDA}/include -I$MARC_SOURCE/mdsrc $I8DEFINES -Xcompiler -fvisibility=hidden -Xcompiler -fPIC $I8DEFINES "
|
|
||||||
NVCCLIB="ar rvl"
|
|
||||||
NVCCLD=icc
|
|
||||||
BCSFORTLOW="$FORTLOW -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTRAN="$FORTRAN -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTHIGH="$FORTHIGH -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH="$BCSFORTHIGH"
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSFORTRAN=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORTHIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the tracer and commnet out the next 5 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# INCLUDEMPI="-I$MPI_ROOT/include64 -I$VT_ROOT/include"
|
|
||||||
# LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
LOAD="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FORTLOW -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRAN="$FORTRAN -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FORTHIGH -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FORTRANMNF -fpp -fPIC"
|
|
||||||
CC="$CC -fPIC"
|
|
||||||
CCMNF="$CCMNF -fPIC"
|
|
||||||
CC_CASI="$CC_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH_CASI -fPIC"
|
|
||||||
LINK_EXE_MARC="-L$MARC_LIB -lmarc -L$MARC_LIB_SHARED -lguide -lpthread"
|
|
||||||
LINK_MARC_DLL="-shared -fPIC"
|
|
||||||
LOAD_DLL=$LOAD
|
|
||||||
LOADT_DLL=$LOADT
|
|
||||||
EXT_DLL="so"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
XLIBS="-L/usr/X11/lib -lX11 "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define archive and ranlib syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
ARC="ar rvl"
|
|
||||||
ARD="ar dvl"
|
|
||||||
ARX="ar xl"
|
|
||||||
RAN=""
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# choose which libraries you want to use ( e.g. blas )
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS="$MARC_LIB/vkisolver.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS="$MARC_CASI/casilib.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS=
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS="$MARC_LIB/mf2parallel/libseq.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libsym.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmet.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libnum.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libutl.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libr8.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libz.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS="$MARC_LIB/libmumps.a"
|
|
||||||
if test $MPITYPE = none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
echo hello > /dev/null
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS=
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcsgpulib.a "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS1="-L${MARC_LIB}/cuda_dummy -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS2="-L${MARC_LIB}/cuda -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS=$MARCCUDALIBS1
|
|
||||||
CUDALIBS="-L$MARC_CUDA/lib64 -lcudart -lcublas -L/usr/lib64 -lcuda "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcslib.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_lp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_core.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_ilp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_core.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SECLIBS="-L$MARC_LIB -llapi"
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS="${BCSSOLVERLIBS} ${VKISOLVERLIBS} ${CASISOLVERLIBS} ${INTELSOLVERLIBS} ${MF2SOLVERLIBS} ${MUMPSSOLVERLIBS2} \
|
|
||||||
$MKLLIB -L$MARC_MKL -liomp5 \
|
|
||||||
$MARC_LIB/blas_src.a ${ACSI_LIB}/ACSI_MarcLib.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS_DLL=${SOLVERLIBS}
|
|
||||||
|
|
||||||
MRCLIBS="$MARC_LIB/clib.a ${CASISOLVERLIBS}"
|
|
||||||
MRCLIBSPAR="$MARC_LIB/clib.a"
|
|
||||||
STUBS="$MARC_LIB/stubs.a "
|
|
||||||
MNFLIBS="$MARC_LIB/libmnf.a"
|
|
||||||
MDUSER="$MARC_LIB/md_user.a"
|
|
||||||
|
|
||||||
OPENMP="-openmp"
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBS=" $OPENMP -lpthread "
|
|
||||||
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the trace and comment out the next 4 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# SYSLIBS="-L${VT_ROOT}/lib -lVT -ldwarf -lelf -lm -lpthread \
|
|
||||||
# -L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt"
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SYSLIBS="-L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt $OPENMP -threads -lpthread "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBSPAR=" "
|
|
||||||
|
|
||||||
MARC_DLL_CODES="runmarc.f"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BLAS_SRC="dzero.f icopy.f izero.f"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
BLAS_SRC="$BLAS_SRC dsctr.f zsctr.f dzasum.f daxpyi.f zaxpyi.f dgthr.f zgthr.f"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BLAS_SRC="ALL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="are163.f contro.f ndext.f omarc.f omarca.f omarcb.f omarcc.f \
|
|
||||||
omars.f fixbc.f triang.f bet049.f norst3.f eldata.f \
|
|
||||||
elec*.f elct*.f fmeig.f oada00.f ogeig.f updtrbe2.f cycrota.f \
|
|
||||||
cordef.f ogpk.f ogtan.f eldam.f formrbe3.f \
|
|
||||||
inertie.f em_sso072.f cn_fol3d_qpatch6.f cosim_begin.f"
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i8" ; then
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="$LOW_OPT_CODES bbcseg.f"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES_CASI=""
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES="dpsmsa1.f dpsmsa2.f dpsmsa3.f dpsmsa4.f dpsmsa5.f dpsmsa6.f \
|
|
||||||
dpsmsa7.f dpsmsa8.f dpsmsa9.f dpsmsa10.f dpsmsa11.f dpsmsa12.f \
|
|
||||||
dpsmsa13.f dpsmsa14.f dpsmsa15.f dpsmsa16.f dpsmsah.f tpsmsah.f cn_qsort4_11.f "
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES_CASI="arithkernels.c blockedroutines.c blockedroutines_fd.c elemmatgenkernels.c longvecroutines.c sfmultutils.c solvewithbd.c"
|
|
||||||
|
|
||||||
MAXNUM=1000000
|
|
||||||
|
|
@ -1,688 +0,0 @@
|
||||||
#
|
|
||||||
# General definitions for the Marc 2014 version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# EM64T
|
|
||||||
# ( LP64 - i4 version)
|
|
||||||
# (ILP64 - i8 version)
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Linux RedHat 5.7
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# 64 bit MPI version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) Fortran Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Intel(R) C Compiler
|
|
||||||
# Version 13.0.1
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MKL Libraries:
|
|
||||||
# Intel(R) MKL 10.3
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# DATE
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the O/S level, type:
|
|
||||||
# uname -a
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# Distributed parallel MPI libraries:
|
|
||||||
# 1) HP MPI 2.3
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
# 2) Intel MPI 4.0
|
|
||||||
# To check the mpi version, type:
|
|
||||||
# mpirun -version
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# To check the Compiler level, type using the compiler
|
|
||||||
# installation path:
|
|
||||||
# ifort -V
|
|
||||||
# icc -V
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# REMARKS : This file contains the definitions of variables used during
|
|
||||||
# compilation loading and use of the MARC programmes . The
|
|
||||||
# current machine type is identified by means of the variable
|
|
||||||
# MACHINE , defined below.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# MPI_ROOT: root directory in which mpi shared libraries, etc. are located
|
|
||||||
# DIRJOB : directory in which spawned jobs should look for Marc input
|
|
||||||
# MPI_ARCH: system architecture
|
|
||||||
# MPI_EPATH: path where executable resides
|
|
||||||
#
|
|
||||||
REVISION="VERSION, BUILD"
|
|
||||||
HOSTNAME=`hostname`
|
|
||||||
|
|
||||||
# find available memory in Mbyte on the machine
|
|
||||||
# can be set explicitly
|
|
||||||
MEMLIMIT=`free -m | awk '/Mem:/ {print $2}'`
|
|
||||||
|
|
||||||
# set _OEM_NASTRAN to 1 for MD Nastran build
|
|
||||||
# override _OEM_NASTRAN setting with MARC_MD_NASTRAN environment variable
|
|
||||||
_OEM_NASTRAN="${MARC_MD_NASTRAN:-0}"
|
|
||||||
|
|
||||||
# uncomment the following line for an autoforge build
|
|
||||||
#AUTOFORGE=1
|
|
||||||
AUTOFORGE=0
|
|
||||||
export AUTOFORGE
|
|
||||||
|
|
||||||
# integer size
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "" ; then
|
|
||||||
INTEGER_PATH=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTEGER_PATH=/$MARC_INTEGER_SIZE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FCOMP=ifort
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for Metis
|
|
||||||
#
|
|
||||||
METIS="-I$METIS_SOURCE/include"
|
|
||||||
METISLIBS="$MARC_LIB/metis.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# RCP and RSH are used for parallel network runs
|
|
||||||
# replace with similar commands like rsh if needed
|
|
||||||
RCP=/usr/bin/scp
|
|
||||||
RSH=/usr/bin/ssh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MPI_DEFAULT=intelmpi
|
|
||||||
MPI_OTHER=hpmpi
|
|
||||||
|
|
||||||
MPITYPE=$MPI_DEFAULT
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $AUTOFORGE = 1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
# overrule MPITYPE setting with environmental variable MARC_MPITYPE
|
|
||||||
if test $MARC_MPITYPE
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=$MARC_MPITYPE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set MPITYPE to none for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MPITYPE=none
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with GPGPU version of BCS Solver for
|
|
||||||
# NVIDIA platforms
|
|
||||||
#BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=BCSGPU
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERFLAGS=
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DBCSGPU -DCUDA"
|
|
||||||
BCS_DIR=bcsgpusolver
|
|
||||||
export PATH=$MARC_CUDA/bin:$MARC_CUDA/nvvm:$PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MARC_CUDA/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCS_DIR=bcssolver
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# settings for MPI
|
|
||||||
#
|
|
||||||
DDM=
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpif90
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_HPMPI
|
|
||||||
export MPI_REMSH=$RSH
|
|
||||||
export MPI_F77=$FCOMP
|
|
||||||
ARCHITECTURE=linux_amd64
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include/64 -DDDM -DHPMPI"
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
export MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE:$MARC_LIB:$MARC_LIB_SHARED:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="-e MPI_FLAGS=E,T,y1"
|
|
||||||
# Below line is moved in run_marc file
|
|
||||||
# export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e BINDIR=$MARC_BIN"
|
|
||||||
if test -n "$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MSC_LICENSE_FILE=$MSC_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test -n "$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e LM_LICENSE_FILE=$LM_LICENSE_FILE"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
export MPIHPSPECIAL="$MPIHPSPECIAL -e MPI_LIC_CHECKER=$MPI_ROOT/bin/licensing/amd64_s8/lichk.x"
|
|
||||||
RUN_JOB2="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -f "
|
|
||||||
RUN_JOB1="$MPI_ROOT/bin/mpirun ${MPIRUNOPTIONS} -prot -w $MPIHPSPECIAL -np "
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
INTELMPI_VERSION=HYDRA
|
|
||||||
FCOMPMPI=mpiifort
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_INTELMPI
|
|
||||||
DDM="-I${MPI_ROOT}/include64 -DDDM"
|
|
||||||
PATH=$MPI_ROOT/bin64:$PATH
|
|
||||||
export PATH
|
|
||||||
LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
export LD_LIBRARY_PATH
|
|
||||||
if test $INTELMPI_VERSION = HYDRA
|
|
||||||
then
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec.hydra -genvall"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
RUN_JOB1="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -n "
|
|
||||||
RUN_JOB2="${MPI_ROOT}/bin64/mpiexec -configfile "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
RUN_JOB0=
|
|
||||||
MPI_CLEAN=
|
|
||||||
MPI_EPATH=$MARC_BIN
|
|
||||||
MPIR_HOME=$MPI_ROOT
|
|
||||||
MPICH_F77=$FCOMP
|
|
||||||
MPICH_F77LINKER=$FCOMP
|
|
||||||
export MPI_ROOT MPI_EPATH MPIR_HOME MPICH_F77 MPICH_F77LINKER
|
|
||||||
I_MPI_PIN_DOMAIN=node
|
|
||||||
export I_MPI_PIN_DOMAIN
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
export MPI_ROOT=$MARC_DUMMYMPI
|
|
||||||
DDM="-I$MPI_ROOT/include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# variables for the "maintain" script
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
MACHINENAME=LINUX
|
|
||||||
MACHINE64BIT=yes
|
|
||||||
MACHINE=Linux_EM64T
|
|
||||||
DEV=/dev/tape
|
|
||||||
GETLOG="whoami"
|
|
||||||
CLEAR="clear"
|
|
||||||
MY_UNAME=`uname -a`
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with VKI Solver
|
|
||||||
#VKISOLVER=VKI
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with CASI Solver
|
|
||||||
CASISOLVER=CASI
|
|
||||||
if test "$MARC_CASISOLVER" = "NONE" ; then
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build with MF2 Solver
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
#MF2SOLVER=SERIAL
|
|
||||||
#MF2SOLVER=MF2PARALLEL
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with Intel(c) Multithreaded solver (PARDISO)
|
|
||||||
#INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=PARDISO
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following lines to build with MUMPS
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
else
|
|
||||||
#MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=MUMPS
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# Edit following 2 lines to build MARC dynamic shared library
|
|
||||||
MARC_DLL=MARC_DLL
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
|
|
||||||
# always set VKISOLVER, CASISOLVER, BCSGPUSOLVER, and MARC_DLL to NONE for MD Nastran
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVER=NONE
|
|
||||||
CASISOLVER=NONE
|
|
||||||
MF2SOLVER=NONE
|
|
||||||
INTELSOLVER=NONE
|
|
||||||
MUMPSSOLVER=NONE
|
|
||||||
BCSGPUSOLVER=NONE
|
|
||||||
MARC_DLL=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define Fortran and C compile syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DVKI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DCASI"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2PARALLEL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2SERIAL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMF2SERIAL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DPARDISO"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMUMPS"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SOLVERFLAGS="$SOLVERFLAGS -DMARC_DLL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LINK_OPT=
|
|
||||||
DEBUG_OPT=
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT=
|
|
||||||
|
|
||||||
#Uncomment following line to build Marc in debuggable mode
|
|
||||||
MARCDEBUG=
|
|
||||||
#MARCDEBUG="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LINK_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="-debug -traceback"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCHECK=
|
|
||||||
#MARCCHECK="ON"
|
|
||||||
if test "$MARCCHECK" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DEBUG_OPT="$DEBUG_OPT -fpe0 -fp-stack-check -check all -ftrapuv "
|
|
||||||
C_DEBUG_OPT="$C_DEBUG_OPT -fp-stack-check -check-uninit -Wformat -ftrapuv "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODECOV=
|
|
||||||
#MARCCODECOV="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
MARCCODEPROF=
|
|
||||||
#MARCCODEPROF="ON"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
I8FFLAGS=
|
|
||||||
I8DEFINES=
|
|
||||||
I8CDEFINES=
|
|
||||||
I8CASIDEFS=
|
|
||||||
else
|
|
||||||
I8FFLAGS="-i8"
|
|
||||||
I8DEFINES="-DI64"
|
|
||||||
I8CDEFINES="-U_DOUBLE -D_SINGLE"
|
|
||||||
I8CASIDEFS="-DCASI_64BIT_INT=1"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MTHREAD=OPENMP
|
|
||||||
if test "$MARC_OPENMP" = "NONE" ; then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
#MTHREAD=NONE
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MTHREAD=NONE
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
OMP_COMPAT=YES
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "NONE"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
OMP_COMPAT=NO
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CDEFINES=
|
|
||||||
FDEFINES=
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_OEM_NASTRAN"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_IMPLICITNONE"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -eq 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DMKL -DOPENMP"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -DOMP_COMPAT"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
# -D_MSCMARC
|
|
||||||
FDEFINES="$FDEFINES -D_MSCMARC $DEBUG_OPT"
|
|
||||||
CDEFINES="$CDEFINES -D_MSCMARC $C_DEBUG_OPT $I8CDEFINES"
|
|
||||||
|
|
||||||
CINCL="-I$MARC_SOURCE/mdsrc -I$MARC_SOURCE/csource $METIS"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CINCL="$CINCL -I../../include"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
CC="icc -c -O1 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -O0 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -O3 $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CC="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCLOW="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
CCHIGH="icc -c -DLinux $I8DEFINES -DLINUX -DLinux_intel $CDEFINES $CINCL $SOLVERFLAGS "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOAD_CC="icc -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel"
|
|
||||||
CCT="$CC"
|
|
||||||
CCTLOW="$CCLOW"
|
|
||||||
CCTHIGH="$CCHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
CC_CASI="$CC -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
CCT_CASI="$CCT -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTLOW_CASI="$CCLOW -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
CCTHIGH_CASI="$CCHIGH -std=c99 $I8CASIDEFS"
|
|
||||||
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=lines"
|
|
||||||
#PROFILE="-Mprof=func,mpi"
|
|
||||||
PROFILE=
|
|
||||||
if test "$MARCCODECOV" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE="-prof-gen=srcpos"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test "$MARCCODEPROF" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
PROFILE=" $PROFILE -pg"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORT_OPT="-c -assume byterecl -safe_cray_ptr -mp1 -WB"
|
|
||||||
if test "$MTHREAD" = "OPENMP"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp"
|
|
||||||
if test "$OMP_COMPAT" = "YES"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -openmp-threadprivate=compat"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
# FORT_OPT=" $FORT_OPT -auto "
|
|
||||||
FORT_OPT=" $FORT_OPT -save -zero"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O0 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -O1 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias -O3 $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTRAN="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FCOMP $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM $SOLVERFLAGS"
|
|
||||||
FORTNA="$FCOMP $FORT_OPT -fno-alias $I8FFLAGS -I$MARC_SOURCE/common \
|
|
||||||
-I$MARC_SOURCE/${BCS_DIR}/common -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include $I8DEFINES -DLinux -DLINUX -DLinux_intel $FDEFINES $DDM"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTLOWT="$FORTLOW"
|
|
||||||
FORTRANT="$FORTRAN"
|
|
||||||
FORTHIGHT="$FORTHIGH"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FCOMP -c $FDEFINES "
|
|
||||||
CCMNF="icc -c -O1 -DLinux -DLINUX -DLinux_intel -Dport2egcs -I$MARC_SOURCE/marctoadams/mnf/include -D_LARGEFILE64_SOURCE"
|
|
||||||
|
|
||||||
FORTRANMUMPS="$FCOMP -fpp $FORT_OPT $PROFILE -fno-alias -O1 -fp-model precise $FDEFINES -D_IMPLICITNONE $I8FFLAGS $I8DEFINES $DDM -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include -Dintel_ -DALLOW_NON_INIT -Dmetis -nofor_main"
|
|
||||||
CCMUMPS="icc -c -DAdd_ -Dmetis -I$MARC_SOURCE/mumpssolver/include"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BCSCC="icc -c -O3 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_csrc $CDEFINES $CINCL"
|
|
||||||
NVCC="nvcc -c -O3 -arch sm_20 -DLOWERCASE_ -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/bcslib_cuda/include -I${MARC_CUDA}/include -I$MARC_SOURCE/mdsrc $I8DEFINES -Xcompiler -fvisibility=hidden -Xcompiler -fPIC $I8DEFINES "
|
|
||||||
NVCCLIB="ar rvl"
|
|
||||||
NVCCLD=icc
|
|
||||||
BCSFORTLOW="$FORTLOW -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTRAN="$FORTRAN -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORTHIGH="$FORTHIGH -I${MARC_SOURCE}/${BCS_DIR}/common"
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH="$BCSFORTHIGH"
|
|
||||||
if test "$MARCDEBUG" = "ON"
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSFORTRAN=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORTHIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
BCSFORT90HIGH=$BCSFORTLOW
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test $MPITYPE != none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin/$FCOMPMPI ${LOADOPTIONS} -L$MPI_ROOT/lib/$ARCHITECTURE $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the tracer and commnet out the next 5 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# INCLUDEMPI="-I$MPI_ROOT/include64 -I$VT_ROOT/include"
|
|
||||||
# LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $INCLUDEMPI -g -t=log $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
LOAD="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$MPI_ROOT/bin64/$FCOMPMPI $PROFILE $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
LOAD="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
LOADT="$FCOMP $LINK_OPT -o "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_DLL" = MARC_DLL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
FORTLOW="$FORTLOW -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRAN="$FORTRAN -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTHIGH="$FORTHIGH -fpp -fPIC"
|
|
||||||
FORTRANMNF="$FORTRANMNF -fpp -fPIC"
|
|
||||||
CC="$CC -fPIC"
|
|
||||||
CCMNF="$CCMNF -fPIC"
|
|
||||||
CC_CASI="$CC_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCLOW_CASI="$CCLOW_CASI -fPIC"
|
|
||||||
CCHIGH_CASI="$CCHIGH_CASI -fPIC"
|
|
||||||
LINK_EXE_MARC="-L$MARC_LIB -lmarc -L$MARC_LIB_SHARED -lguide -lpthread"
|
|
||||||
LINK_MARC_DLL="-shared -fPIC"
|
|
||||||
LOAD_DLL=$LOAD
|
|
||||||
LOADT_DLL=$LOADT
|
|
||||||
EXT_DLL="so"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
XLIBS="-L/usr/X11/lib -lX11 "
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# define archive and ranlib syntax
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
ARC="ar rvl"
|
|
||||||
ARD="ar dvl"
|
|
||||||
ARX="ar xl"
|
|
||||||
RAN=""
|
|
||||||
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# choose which libraries you want to use ( e.g. blas )
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$VKISOLVER" = VKI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS="$MARC_LIB/vkisolver.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
VKISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$CASISOLVER" = CASI
|
|
||||||
then
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS="$MARC_CASI/casilib.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
CASISOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS=
|
|
||||||
if test "$MF2SOLVER" = MF2PARALLEL
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MF2SOLVERLIBS="$MARC_LIB/mf2parallel/libseq.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libsym.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmet.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libmf2.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libgauss.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libnum.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libutl.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libr8.a \
|
|
||||||
$MARC_LIB/mf2parallel/libz.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$INTELSOLVER" = PARDISO
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS="$MARC_MKL/libmkl_solver_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
INTELSOLVERLIBS=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MUMPSSOLVER" = MUMPS
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS="$MARC_LIB/libmumps.a"
|
|
||||||
if test $MPITYPE = none
|
|
||||||
then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
echo hello > /dev/null
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = hpmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=" $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS=
|
|
||||||
MUMPSSOLVERLIBS2=
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$BCSGPUSOLVER" = BCSGPU
|
|
||||||
then
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcsgpulib.a "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS1="-L${MARC_LIB}/cuda_dummy -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS2="-L${MARC_LIB}/cuda -lmarccuda "
|
|
||||||
MARCCUDALIBS=$MARCCUDALIBS1
|
|
||||||
CUDALIBS="-L$MARC_CUDA/lib64 -lcudart -lcublas -L/usr/lib64 -lcuda "
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BCSSOLVERLIBS="${MARC_LIB}/bcslib.a "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_lp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_lp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_core.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
MKLLIB="$MARC_MKL/libmkl_scalapack_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_blacs_ilp64.a -Wl,--start-group $MARC_MKL/libmkl_intel_ilp64.a $MARC_MKL/libmkl_intel_thread.a $MARC_MKL/libmkl_core.a -Wl,--end-group"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SECLIBS="-L$MARC_LIB -llapi"
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS="${BCSSOLVERLIBS} ${VKISOLVERLIBS} ${CASISOLVERLIBS} ${INTELSOLVERLIBS} ${MF2SOLVERLIBS} ${MUMPSSOLVERLIBS2} \
|
|
||||||
$MKLLIB -L$MARC_MKL -liomp5 \
|
|
||||||
$MARC_LIB/blas_src.a ${ACSI_LIB}/ACSI_MarcLib.a "
|
|
||||||
|
|
||||||
SOLVERLIBS_DLL=${SOLVERLIBS}
|
|
||||||
|
|
||||||
MRCLIBS="$MARC_LIB/clib.a ${CASISOLVERLIBS}"
|
|
||||||
MRCLIBSPAR="$MARC_LIB/clib.a"
|
|
||||||
STUBS="$MARC_LIB/stubs.a "
|
|
||||||
MNFLIBS="$MARC_LIB/libmnf.a"
|
|
||||||
MDUSER="$MARC_LIB/md_user.a"
|
|
||||||
|
|
||||||
OPENMP="-openmp"
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBS=" $OPENMP -lpthread -shared-intel "
|
|
||||||
|
|
||||||
# Uncomment the following lines to turn on the trace and comment out the next 4 lines
|
|
||||||
# if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
# then
|
|
||||||
# SYSLIBS="-L${VT_ROOT}/lib -lVT -ldwarf -lelf -lm -lpthread \
|
|
||||||
# -L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt"
|
|
||||||
# fi
|
|
||||||
if test $MPITYPE = intelmpi
|
|
||||||
then
|
|
||||||
SYSLIBS="-L${MPI_ROOT}/lib64 -lmpi -lmpiif -lmpigi -lrt $OPENMP -threads -lpthread -shared-intel "
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SYSLIBSPAR=" "
|
|
||||||
|
|
||||||
MARC_DLL_CODES="runmarc.f"
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
BLAS_SRC="dzero.f icopy.f izero.f"
|
|
||||||
if test "$_OEM_NASTRAN" -ne 0
|
|
||||||
then
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i4" ; then
|
|
||||||
BLAS_SRC="$BLAS_SRC dsctr.f zsctr.f dzasum.f daxpyi.f zaxpyi.f dgthr.f zgthr.f"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
BLAS_SRC="ALL"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="are163.f contro.f ndext.f omarc.f omarca.f omarcb.f omarcc.f \
|
|
||||||
omars.f fixbc.f triang.f bet049.f norst3.f eldata.f \
|
|
||||||
elec*.f elct*.f fmeig.f oada00.f ogeig.f updtrbe2.f cycrota.f \
|
|
||||||
cordef.f ogpk.f ogtan.f eldam.f formrbe3.f \
|
|
||||||
inertie.f em_sso072.f cn_fol3d_qpatch6.f cosim_begin.f"
|
|
||||||
if test "$MARC_INTEGER_SIZE" = "i8" ; then
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES="$LOW_OPT_CODES bbcseg.f"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
LOW_OPT_CODES_CASI=""
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES="dpsmsa1.f dpsmsa2.f dpsmsa3.f dpsmsa4.f dpsmsa5.f dpsmsa6.f \
|
|
||||||
dpsmsa7.f dpsmsa8.f dpsmsa9.f dpsmsa10.f dpsmsa11.f dpsmsa12.f \
|
|
||||||
dpsmsa13.f dpsmsa14.f dpsmsa15.f dpsmsa16.f dpsmsah.f tpsmsah.f cn_qsort4_11.f "
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
HIGH_OPT_CODES_CASI="arithkernels.c blockedroutines.c blockedroutines_fd.c elemmatgenkernels.c longvecroutines.c sfmultutils.c solvewithbd.c"
|
|
||||||
|
|
||||||
MAXNUM=1000000
|
|
||||||
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
File diff suppressed because it is too large
Load Diff
|
|
@ -1,5 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
# This script opens a window running an editor.
|
|
||||||
# The command to invoke the editor is specified during DAMASK installation
|
|
||||||
|
|
||||||
%EDITOR% $*
|
|
||||||
|
|
@ -1,18 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
# This script opens a window running an editor. The default window is an
|
|
||||||
# xterm, and the default editor is vi. These may be customized.
|
|
||||||
|
|
||||||
dir=
|
|
||||||
for d in /usr/bin /usr/bin/X11; do
|
|
||||||
if test -x "$d/xterm"; then
|
|
||||||
dir="$d"
|
|
||||||
break
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
done
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$dir"; then
|
|
||||||
echo "$0: Could not find xterm"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
"$dir/xterm" -T "vi $*" -n "vi $*" -e vi $*
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,8 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$1" = "" ]; then
|
|
||||||
echo "usage: $0 job_name"
|
|
||||||
exit 1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
echo STOP > $1.cnt
|
|
||||||
|
|
@ -1,186 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=/msc/marc2015
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_marc" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_hmp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_mp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_lmp" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_h" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
||||||
|
|
@ -1,187 +0,0 @@
|
||||||
#!/bin/sh
|
|
||||||
#
|
|
||||||
# The exit status of this script is read by Mentat.
|
|
||||||
# Normal exit status is 0.
|
|
||||||
#
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR=%INSTALLDIR%/marc%VERSION%
|
|
||||||
if test $MARCDIR1
|
|
||||||
then
|
|
||||||
DIR=$MARCDIR1
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if test -z "$DIR"; then
|
|
||||||
REALCOM="`ls -l $0 |awk '{ print $NF; }'`"
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`dirname $REALCOM`
|
|
||||||
case $DIRSCRIPT in
|
|
||||||
\/*)
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
*)
|
|
||||||
DIRSCRIPT=`pwd`/$DIRSCRIPT
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
. $DIRSCRIPT/getarch
|
|
||||||
|
|
||||||
DIR="$MENTAT_MARCDIR"
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
SRCEXT=.f
|
|
||||||
SRCEXTC=.F
|
|
||||||
RSTEXT=.t08
|
|
||||||
PSTEXT=.t19
|
|
||||||
PSTEXTB=.t16
|
|
||||||
VWFCEXT=.vfs
|
|
||||||
|
|
||||||
slv=$1
|
|
||||||
version=$2
|
|
||||||
ndom_fea_solver=$3
|
|
||||||
ndom_preprocessor=$4
|
|
||||||
hostfile=$5
|
|
||||||
compat=$6
|
|
||||||
job=$7
|
|
||||||
srcfile=$8
|
|
||||||
srcmeth=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
restart=$1
|
|
||||||
postfile=$2
|
|
||||||
viewfactorsfile=$3
|
|
||||||
autorst=$4
|
|
||||||
copy_datfile="-ci $5"
|
|
||||||
copy_postfile="-cr $6"
|
|
||||||
scr_dir=$7
|
|
||||||
dcoup=$8
|
|
||||||
assem_recov_nthread=$9
|
|
||||||
shift 9 # cannot use $10, $11, ...
|
|
||||||
nthread=$1
|
|
||||||
nsolver=$2
|
|
||||||
mode=$3
|
|
||||||
gpu=$4
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$slv" != "" -a "$slv" != "marc" ]; then
|
|
||||||
slv="-iam sfm"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
slv=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$ndom_fea_solver" != "" -a "$ndom_fea_solver" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocds="-nprocds $ndom_fea_solver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
if [ "$ndom_preprocessor" != "" -a "$ndom_preprocessor" != "1" ]; then
|
|
||||||
nprocd="-nprocd $ndom_preprocessor"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nprocd=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$srcfile" != "" -a "$srcfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
srcfile=`echo $srcfile | sed "s/$SRCEXT$//" | sed "s/$SRCEXTC$//"`
|
|
||||||
case "$srcmeth" in
|
|
||||||
-)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
compsave)
|
|
||||||
srcfile="-u $srcfile -save y"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
runsaved)
|
|
||||||
srcfile=${srcfile%.*}".marc"
|
|
||||||
srcfile="-prog $srcfile"
|
|
||||||
;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
else
|
|
||||||
srcfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$restart" != "" -a "$restart" != "-" ]; then
|
|
||||||
restart=`echo $restart | sed "s/$RSTEXT$//"`
|
|
||||||
restart="-r $restart"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
restart=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$postfile" != "" -a "$postfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXT$//"`
|
|
||||||
postfile=`echo $postfile | sed "s/$PSTEXTB$//"`
|
|
||||||
postfile="-pid $postfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
postfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$viewfactorsfile" != "" -a "$viewfactorsfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
viewfactorsfile=`echo $viewfactorsfile | sed "s/$VWFCEXT$//"`
|
|
||||||
viewfactorsfile="-vf $viewfactorsfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
viewfactorsfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$hostfile" != "" -a "$hostfile" != "-" ]; then
|
|
||||||
hostfile="-ho $hostfile"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
hostfile=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$compat" != "" -a "$compat" != "-" ]; then
|
|
||||||
compat="-co $compat"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
compat=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$scr_dir" != "" -a "$scr_dir" != "-" ]; then
|
|
||||||
scr_dir="-sd $scr_dir"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
scr_dir=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$dcoup" != "" -a "$dcoup" != "0" ]; then
|
|
||||||
dcoup="-dcoup $dcoup"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
dcoup=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$assem_recov_nthread" != "" -a "$assem_recov_nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
assem_recov_nthread="-nthread_elem $assem_recov_nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
assem_recov_nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nthread" != "" -a "$nthread" != "0" -a "$nthread" != "1" ]; then
|
|
||||||
nthread="-nthread $nthread"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nthread=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$nsolver" != "" -a "$nsolver" != "0" ]; then
|
|
||||||
nsolver="-nsolver $nsolver"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
nsolver=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
case "$mode" in
|
|
||||||
4) mode="-mo i4" ;;
|
|
||||||
8) mode="-mo i8" ;;
|
|
||||||
*) mode= ;;
|
|
||||||
esac
|
|
||||||
|
|
||||||
if [ "$gpu" != "" -a "$gpu" != "-" ]; then
|
|
||||||
gpu="-gpu $gpu"
|
|
||||||
else
|
|
||||||
gpu=""
|
|
||||||
fi
|
|
||||||
|
|
||||||
rm -f $job.cnt
|
|
||||||
rm -f $job.sts
|
|
||||||
rm -f $job.out
|
|
||||||
rm -f $job.log
|
|
||||||
|
|
||||||
# To prevent a mismatch with the python version used by the solver
|
|
||||||
# do *not* prepend $MENTAT_INSTALL_DIR/python/bin to environment variable PATH
|
|
||||||
# unset environment variables PYTHONHOME and PYTHONPATH
|
|
||||||
unset PYTHONHOME
|
|
||||||
unset PYTHONPATH
|
|
||||||
|
|
||||||
"${DIR}/tools/run_damask_l" $slv -j $job -v n -b y $nprocds $nprocd -autorst $autorst \
|
|
||||||
$srcfile $restart $postfile $viewfactorsfile $hostfile \
|
|
||||||
$compat $copy_datfile $copy_postfile $scr_dir $dcoup \
|
|
||||||
$assem_recov_nthread $nthread $nsolver $mode $gpu > /dev/null 2>&1
|
|
||||||
sleep 1
|
|
||||||
exit 0
|
|
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